vasp和ms_武汉理工大学赵焱课题组开发脚本 MS建模一键获取VASP输入文件POSCAR

本文给大家推介并分享一个通过Materials Studio一键获取VASP输入文件POSCAR的脚本，xsd2pos.pl。此脚本是武汉理工大学首席教授赵焱在帮助学生解决VASP计算问题时编写，解决了其他间接非手动获取POSCAR存在的问题，同时也相较于其他方法更为便捷，相信会对从事VASP计算的同行们带来便利。赵焱老师怀着哺育天下学子的情怀，希望给大家分享一下。

下文介绍一下它的使用方法以及它所解决的问题，在此就不给大家介绍脚本的内容了，会编程的朋友们可自行学习。

使用方法

此脚本适用于用Materials Studio 建模获取POSCAR，操作非常简单。

(1)把xsd2pos.pl脚本直接拖至需要转化成POSCAR的xsd格式文件所在目录。示例中，我们将TiO2_single.xsd转化成POSCAR。

(2)将xsd2pos.pl打开，将第12行引号中的内容改写成需转化的xsd文件的名字。

(3)点击上图紫红色框中的三角形按钮运行脚本便生成了POSCAR文件，如下图。

解决的问题

此脚本的诞生源于赵焱老师的学生运用cel2pos.pl 脚本和Vesta生成POSCAR时不能便利地选择性固定原子。赵焱老师为了解决这个问题，花了半天时间为学生们创造了该脚本。不得不说，尽管赵焱老师作为计算化学专家，编个脚本不费吹灰之力，但在繁重的教学任务、科研任务之下，半天的时间于他而言实为珍贵。

一般大家构造表面模型时，需要选择性固定几层原子以模拟体相结构。

如下图是一个TiO2(101)表面结构模型，