Matlab在ubuntu上运行速度,以MATLAB一半的速度运行

我一直在将MATLAB代码移植到Python上，经过大量的工作，我有了一些有用的东西。但是，缺点是Python运行我的代码比MATLAB慢。我知道使用优化的ATLAS库会加快速度，但实际上实现这一点让我很困惑。事情是这样的：

我在没有安装BLAS的情况下启动ipython会话：import numpy.distutils.system_info as sysinfo

import time

In [11]: sysinfo.get_info('atlas')

Out[11]: {}

timeit( eig(randn(1E2,1E2)) )

100 loops, best of 3: 13.4 ms per loop

Matlab中相同的代码运行速度是原来的两倍

^{pr2}$

我从Ubuntu存储库安装非优化的ATAS deb。重新启动ipython，现在我得到：In [2]: sysinfo.get_info('atlas')

...

Out[2]:

{'define_macros': [('ATLAS_INFO', '"\\"3.8.4\\""')],

'include_dirs': ['/usr/include/atlas'],

'language': 'f77',

'libraries': ['lapack', 'f77blas', 'cblas', 'atlas'],

'library_dirs': ['/usr/lib/atlas-base/atlas', '/usr/lib/atlas-base']}

以及测试代码：In [4]: timeit( eig(randn(1E2,1E2)) )

100 loops, best of 3: 16.8 ms per loop

所以不要再快了。如果稍微慢一点的话。我还没换成BLAS。我遵循以下说明：http://danielnouri.org/notes/category/python/我构建库并用这些库覆盖未优化的版本。我重新启动了ipython，但没有变化：In [4]: timeit( eig(randn(1E2,1E2)) )

100 loops, best of 3: 15.3 ms per loop

就不能比这更好吗？在这个简单的例子中，MATLAB的速度仍然是原来的两倍。在一个真实的例子中，我在Fourier域中进行图像注册，Matlab的等价物比Python版本快4到5倍。有人设法让纽比以MATLAB的速度工作吗？在