我们展示多维数据时,往往会因为变量太多而感到非常棘手。 今天,小编教大家用R语言绘制常用的多维数据展示图——气泡矩阵图。首先,我们需要准备输入文件。
如上图所示,准备四列数据,分别为X轴、Y轴、数值(控制气泡大小)和分类(控制气泡颜色,可为字符或数字),以"Tab"为分隔符。
准备好输入文件后,我们就可以打开R画图啦~
## 导入R包library("ggplot2")## 导入数据data ## 绘制气泡图p ## 显示气泡图p
执行完命令后,气泡图就画好啦~气泡颜色反映我们输入数据的不同类型,气泡大小反映我们输入数值的高低。
如果想要去除背景边框,可以执行以下代码:## 去除背景边框p + theme(panel.background = element_blank())
简单几步,气泡矩阵图就画好啦~大家赶快试试吧!
具体细节大家可以搜索ggplot2的相关参数,根据自己的需求调整或者将图片导出为PDF格式,通过Adobe illustrator调整。
参考资料:https://blog.csdn.net/biocity/article/details/100187450
R语言绘图更多教程:
motifStack | 绘制motif序列结构图
每个人都用得到的频数分布直方图
使用LDheatmap快速绘制SNP连锁不平衡图
使用ggtree对进化树进行分组美化