随着生物数据越来越多,生物统计学的作用越来越明显了。因此,R语言在生物数据分析和挖掘中扮演着越来越重要的作用,越来越多的分析都可以直接使用R软件来完成。虽然R语言可以在windows和MacOS等图形化界面下使用,也很方便,但是使用Linux版本的R,可以充分利用服务器大的资源,并且命令行版本更适合批量化和自动化。
利用yum安装R
默认的CentOS源中是没有R软件的,需要安装epel源,我们之前已经安装了,R软件在里面的名字为R.x86_64,如果不知道这个名字,可以使用yum search进行搜索。由于yum search不能使用正则表达式进行限制范围,会将所有包含R字符的结果都列出来,这里我们利用一个技巧。
# yum install -y epel-release
yum list |grep "^R
R.x86_64 3.5.2-2.el7 epel
R-RInside.x86_64 0.2.15-1.el7 epel
R-RInside-devel.x86_64 0.2.15-1.el7 epel
R-RInside-examples.x86_64 0.2.15-1.el7 epel