python 三维数组聚类分析_对三维数据集的K-means聚类研究

对三维数据集的K-means聚类研究

本文是在《根据”关于‘k-means算法在流式细胞仪中细胞分类的应用’的学习笔记总结“撰写的中期报告》一文的基础上，对该实验数据中的CD3/CD8/CD45三种抗原分子的三列荧光强度数据在Matlab环境下进行K-means聚类研究。

实验数据地址：http://pan.baidu.com/s/1hqomDq0

由于之前论文查重时查到了一文，现特摘取论文中部分内容修改后辑成本文，文字尽量精简。待论文事情结束后我会在整理成另一篇文章。

对以CD3/CD8/CD45为分类指标所对应的三列光谱数据进行减法聚类。

程序

A=load('CD3-8-45-4.txt');

X=A(:,[4 5 6]);

[C,S]=subclust(X,0.5,[],[1.25 0.5 0.15 0]);

得到聚类中心为

C=

79 75 62

102 74 490

576 74 536

设置参数k=3，进行聚类。

程序

idx3=kmeans(X,3,'dist','city','display','iter');

得到聚类中心为

cent3=

99 78 470

552 97 552

78 78 54

由于都是三维矩阵，为便于比较，可以用三维散点图在三维空间中显示出两组聚类中心，分别用星号*和三角△表示。

程序

plot(0,0)；

hold on

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