计算机技术预测蛋白质结构,蛋白质结构预测:生命科学的又一场竞争

中国学者张阳最近在第七届蛋白质结构预测技术评估大赛中获得第一名的好成绩。消息传来,他做博士后时的导师欧阳钟灿院士给予高度评价。据欧阳钟灿介绍,由生物大分子的基因序列预测其结构,是当前生物学研究面临的最重要挑战之一,如果能够实现,将在生物技术与药物设计领域产生巨大影响。

2006年11月26~30日,第七届CASP总结大会在美国加州阿萨尔默会议中心举行,在大会公布的测评排列名单上,美国堪萨斯大学的助理教授张阳位居第一。

对此,中国科学院院士欧阳钟灿评价说:“CASP被誉为蛋白质结构预测领域的奥林匹克竞赛,张阳获得第一名,表明他已经走在这个领域的最前沿,这个成就令人兴奋。”

蛋白质结构预测技术评估(CASP)大赛是一个世界性的蛋白质结构预测技术评比活动。1994年,第一届CASP在美国马里兰大学生物技术研究所的约翰·莫尔特(John Moult)倡议、组织下举行,此后每两年举行一次。

张阳在华中师范大学师从刘连寿教授并获得物理学博士学位,1999~2000年在中国科学院理论物理所跟随欧阳钟灿院士做博士后,2001年初到美国。张阳说:“比赛获胜说明我们的预测方法的确行之有效,我很高兴看到这一点。在当今蛋白质结构预测这个竞争激烈的领域,赢得CASP比赛胜利是得到同行尊重和承认的最重要和几乎唯一的途径。”

近日,张阳到北京参加会议并到中科院理论物理所访问,在此期间,他接受了《科学时报》的专访。

结构密码蕴藏在排序中

这是一个复杂但很有意思的生命过程——基因承载了生命的遗传信息,生命的功能则是藉由蛋白质执行的;蛋白质是由20种氨基酸组成的肽链,而DNA中的基因控制了蛋白质中氨基酸种类的排序。蛋白质只有

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