r语言热图对列不进行聚类_R语言制作热图的一个小实例-CSDN博客

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热图(heatmap)用不同的颜色和颜色的深浅来展示数据之间的差异，直观、美丽、大方，深受科研工作者的喜爱，尤其是转录组类的文章里，几乎必有一幅热图用来展示差异表达基因。很多工具都可以完成热图的制作，比如我们最常使用的excel；还有一款比较好用的制作热图的工具是CJ大神开发的工具TBtools，在公众号生信札记有比较详细的教程，感兴趣的可以自行搜索相关教程；今天这篇文章主要介绍利用R语言的 pheatmap 包和ggplot2 包制作热图的简单小例子。pheatmap是R语言中专门用来制作热图的工具包；ggplot2是R语言中最常用的可视化工具包。R语言中还有一个专门用来绘制热图的工具包ComplexHeatmap，功能比pheatmap强大，帮助文档非常详细，感兴趣的可以自行查阅帮助文档，在这篇文章中就不做过多介绍。

利用pheatmap制作热图

这部分内容主要来自教程 https://flowingdata.com/2010/01/21/how-to-make-a-heatmap-a-quick-and-easy-solution/。原文用到的数据集：NBA basketball statistics from last season。可是回头再看这篇教程的写作时间已经是2010年了。“上一个赛季(lastseason)”那岂不是要追溯到2008-2009赛季了？那个时候科比还在，卡特未老，麦迪虽已巅峰不在，干拔跳投却依旧销魂；艾弗森虽然远赴掘金，但那份桀骜与坚持依旧感动着无数球迷；那时候纳什还在太阳，小斯还是劲爆的小霸王，再加上防守悍将马里昂，即使是与拥有GDP的马刺也能大战上六场；那时的姚明带领火箭闯进了季后赛第二轮，并与当年的总冠军湖人队大战了7场，同时还上演了王者归来的震撼表演；那时的隆多还在绿军，风城之子才刚刚在芝加哥联合中心球馆绽放…… 那是最好的时代 -- It was the best of times.

哈哈哈……好像有点扯远了，今天的主题是学习R语言制作热图的，不是来怀旧的哈！