biopython中文指南_Biopython 1.74 教程翻译(Chapter 1)

Biopython项目是一个由免费提供的Python(https://www.python.org)工具开发人员的国际协会，用于计算分子生物学。Python是一种面向对象，解释灵活的语言，在科学计算中越来越受欢迎。Python易于学习，语法非常清晰，可以使用C，C ++或FORTRAN编写的模块轻松扩展。

Biopython网站(http://www.biopython.org)为基于Python的软件开发人员提供模块，脚本和Web链接的在线资源，用于生物信息学的使用和研究。基本上，Biopython的目标是通过创建高质量，可重用的模块和类，使Python尽可能容易地用于生物信息学。Biopython功能包括各种生物信息学文件格式(BLAST，Clustalw，FASTA，Genbank等)的解析器，访问在线服务(NCBI，Expasy，...)，与常见和不常见程序的接口(Clustalw， DSSP，MSMS ...)，标准序列类，各种聚类模块，KD树数据结构等甚至文档。

基本上，我们只是想用Python编程，并希望通过创建高质量，可重用的模块和脚本，尽可能简单地将Python用于生物信息学。

1.2 我可以在Biopython包中找到什么

主要的Biopython版本具有许多功能，包括：能够将生物信息学文件解析为Python可利用的数据结构，包括支持以下格式：Blast输出 - 来自单独的blast软件和在线Blast

CLUSTALW

FASTA

GenBank

PubMed和Medline