如何用python自动获取文献_[python]eutilities获取文献题录

之前这篇文章（路人乙小明：用entrez eutilities来查pubmed文献）提过如何利用entrez eutilities查找文献。当时在最后面获取论文摘要和题录的部分直接用了text的模式。最近觉得用xml模式能获得更加细致的数据。比如我如果只想获得题目，杂志，一作，doi这几个信息，如果直接用text获取摘要，然后再用regex就比较容易出错，但是xml就不会有这样的问题（大概……）

况且用python重新写一下那段程序也是好的。

导入各种包

import requests
import os
import xml.etree.ElementTree as ET
import pyperclip
import argparse
import re

requests需要自己安装，是很方便的一个获取网络信息的工具。

os当时导进来主要是为了删除写入的临时文件(os.remove())，调试程序的时候总不能每次都从entrez读数据吧，一来比较慢，二来万一整天发请求会被封的。

xml.etree.ElementTree是python自带的xml解析工具

pyperclip是读取剪切板的工具

argparse是加入命令行参数的工具

re就是正则的包

参数和其他信息准备

reLink = re.compile(r'https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/(d+)')
parser = argparse.ArgumentParser(
    "-i pmid -l pubmed link")
parser.add_argument('-i')
parser.add_argument('-l')
parser.add_argument('-verbose')
parser.add_argument('-paste')

args =