matlab算法用python做_机器学习笔记—朴素贝叶斯算法（matlab/python）

原理知道一百遍不如自己动手写一遍，当然，现在基本上不需要自己来写算法的底层code了，各路大神们已经为我等凡夫俗子写好了，直接调用就行。

这里介绍在MATLAB中和Python中应用贝叶斯算法的小例子。

一、 matlab实现朴素贝叶斯算法

先load matlab中自带的数据集fisheriris，数据集中每一个样本有两个特征，Y代表所属的类。

load fisheriris

X = meas(:,3:4);

Y = species;

tabulate(Y)%返回概率表格

接下来用朴素贝叶斯算法进行拟合，大家可以注意下matlab的机器学习算法的命名规则，都是以'fit'开头,中间一个字母'c’或者‘r’，c’代表是分类算法(classification)，'r’代表回归算法(regression)，后面的字母就是算法的通用名称。

以下是对X、Y进行拟合，指定Y变量中分类的名称分别为'setosa','versicolor'和'virginica'

Mdl = fitcnb(X,Y,'ClassNames',{'setosa','versicolor','virginica'})

Mdl =

ClassificationNaiveBayes

ResponseName: 'Y'

CategoricalPredictors: []

ClassNames: {'setosa' 'versicolor' 'virginica'}

ScoreTransform: 'none'

NumObservations: 150

DistributionNames: {'normal' 'normal'}

DistributionParameters: {3x2 cell}

这里返回了贝叶斯分类器的各种参数，包含分类名称、数据行数是否归一化等。

在matlab中，默认每一个特征的都符合高斯分布，拟合结果中也计算了每一个特征的均值和方差。

假如我们想看分类为‘setosa’类的X的第一个特征的均值和方差。

setosaIndex = strcmp(Mdl.ClassNames,'setosa');

estimates = Mdl.DistributionParameters{setosaIndex,1}

estimates =

1.4620

0.1737

均值是1.4620，方差是0.1737

接下来我们将拟合结果可视化，让大家更直观地感受拟合效果。

figure 打开一个新的画布

gscatter(X(:,1),X(:,2),Y);%画出散点图

h = gca;

cxlim = h.XLim;%获取x轴坐标

cylim = h.YLim; %获取y轴坐标

hold on

Params = cell2mat(Mdl.DistributionParameters);%获取高斯分布的参数

Mu = Params(2*(1:3)-1,1:2); % 提取均值列

Sigma = zeros(2,2,3);

for j = 1:3

Sigma(:,:,j) = diag(Params(2*j,:)).^2; % Create diagonal covariance matrix

xlim = Mu(j,1) + 4*[1 -1]*sqrt(Sigma(1,1,j));

ylim = Mu(j,2) + 4*[1 -1]*sqrt(Sigma(2,2,j));

ezcontour(@(x1,x2)mvnpdf([x1,x2],Mu(j,:),Sigma(:,:,j)),[xlim ylim])

% 绘制多元正态分布的等高线

end

h.XLim = cxlim;%设置X轴显示范围

h.YLim = cylim;%设置Y轴显示范围

title('Naive Bayes Classifier -- Fisher''s Iris Data')

xlabel('Petal Length (cm)')

ylabel('Petal Width (cm)')

hold off

默认情况下，先验类概率分布是根据数据集计算的各类的相对频率分布，在这种情况下，对于每个分类，其相对频率分布均为33%。但是假如你知道在总样本中50%的’ setosa’，20%是’versicolor’，30%’ ViGiCina’。你可以在训练分类器的时候指定先验概率。

prior = [0.5 0.2 0.3];

Mdl = fitcnb(X,Y,'ClassNames',classNames,'Prior',prior)%指定每一类的概率

使用10倍交叉验证估计两个模型的交叉验证误差。

rng(1); % For reproducibility

defaultCVMdl = crossval(defaultPriorMdl);

defaultLoss = kfoldLoss(defaultCVMdl)

CVMdl = crossval(Mdl);

Loss = kfoldLoss(CVMdl)

二、 Python(sklearn实现贝叶斯算法)

1. 利用GaussianNB类建立简单模型

import numpy as np

from sklearn.naive_bayes import GaussianNB

X = np.array([[-1, -1], [-2, -2], [-3, -3],[-4,-4],[-5,-5], [1, 1], [2,2], [3, 3]])

y = np.array([1, 1, 1,1,1, 2, 2, 2])

clf = GaussianNB() #默认priors=None

clf.fit(X,y)

GaussianNB(priors=None)

2. 经过训练集训练后，观察各个属性值

clf.priors #无返回值，因priors=None

clf.set_params(priors=[0.625, 0.375]) #设置priors参数值

GaussianNB(priors=[0.625, 0.375])

clf.priors #返回各类标记对应先验概率组成的列表

clf.class_count_ #获取各类标记对应的训练样本数

clf.sigma_ #获取各个类标记在各个特征上的方差

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