python实现鸢尾花决策树_python实现决策树、随机森林的简单原理

本文申明：此文为学习记录过程，中间多处引用大师讲义和内容。

一、概念

决策树(Decision Tree)是一种简单但是广泛使用的分类器。通过训练数据构建决策树，可以高效的对未知的数据进行分类。决策数有两大优点：1)决策树模型可以读性好，具有描述性，有助于人工分析；2)效率高，决策树只需要一次构建，反复使用，每一次预测的最大计算次数不超过决策树的深度。

看了一遍概念后，我们先从一个简单的案例开始，如下图我们样本：

对于上面的样本数据，根据不同特征值我们最后是选择是否约会，我们先自定义的一个决策树，决策树如下图所示：

对于上图中的决策树，有个疑问，就是为什么第一个选择是“长相”这个特征，我选择“收入”特征作为第一分类的标准可以嘛？下面我们就对构建决策树选择特征的问题进行讨论；在考虑之前我们要先了解一下相关的数学知识：

信息熵：熵代表信息的不确定性，信息的不确定性越大，熵越大；比如“明天太阳从东方升起”这一句话代表的信息我们可以认为为0；因为太阳从东方升起是个特定的规律，我们可以把这个事件的信息熵约等于0；说白了，信息熵和事件发生的概率成反比：数学上把信息熵定义如下：H(X)＝H(P1，P2，…，Pn)＝-∑P(xi)logP(xi)

互信息：指的是两个随机变量之间的关联程度，即给定一个随机变量后，另一个随机变量不确定性的削弱程度，因而互信息取值最小为0，意味着给定一个随机变量对确定一另一个随机变量没有关系，最大取值为随机变量的熵，意味着给定一个随机变量，能完全消除另一个随机变量的不确定性

现在我们就把信息熵运用到决策树特征选择上，对于选择哪个特征我们按照这个规则进行“哪个特征能使信息的确定性最大我们就选择哪个特征”；比如上图的案例中；

第一步：假设约会去或不去的的事件为Y,其信息熵为H(Y)；

第二步：假设给定特征的条件下，其条件信息熵分别为H(Y|长相)，H(Y|收入)，H(Y|身高)

第三步：分别计算信息增益(互信息)：G(Y,长相) = I(Y,长相) = H(Y)-H(Y|长相) 、G(Y,) = I(Y,长相) = H(Y)-H(Y|长相)等

第四部：选择信息增益最大的特征作为分类特征；因为增益信息大的特征意味着给定这个特征，能很大的消除去约会还是不约会的不确定性；

第五步：迭代选择特征即可；

按以上就解决了决策树的分类特征选择问题，上面的这种方法就是ID3方法，当然还是别的方法如 C4.5;等；

二、决策树的过拟合解决办法

若决策树的度过深的话会出现过拟合现象，对于决策树的过拟合有二个方案：

1.剪枝-先剪枝和后剪纸(可以在构建决策树的时候通过指定深度，每个叶子的样本数来达到剪枝的作用)

2.随机森林 --构建大量的决策树组成森林来防止过拟合；虽然单个树可能存在过拟合，但通过广度的增加就会消除过拟合现象

三、随机森林

随机森林是一个最近比较火的算法，它有很多的优点：

在数据集上表现良好

在当前的很多数据集上，相对其他算法有着很大的优势

它能够处理很高维度(feature很多)的数据，并且不用做特征选择

在训练完后，它能够给出哪些feature比较重要

训练速度快

在训练过程中，能够检测到feature间的互相影响

容易做成并行化方法

实现比较简单

随机森林顾名思义，是用随机的方式建立一个森林，森林里面有很多的决策树组成，随机森林的每一棵决策树之间是没有关联的。在得到森林之后，当有一个新的输入样本进入的时候，就让森林中的每一棵决策树分别进行一下判断，看看这个样本应该属于哪一类(对于分类算法)，然后看看哪一类被选择最多，就预测这个样本为那一类。

上一段决策树代码：

# 花萼长度、花萼宽度，花瓣长度，花瓣宽度

iris_feature_E = 'sepal length', 'sepal width', 'petal length', 'petal width'

iris_feature = u'花萼长度', u'花萼宽度', u'花瓣长度', u'花瓣宽度'

iris_class = 'Iris-setosa', 'Iris-versicolor', 'Iris-virginica'

if __name__ == "__main__":

mpl.rcParams['font.sans-serif'] = [u'SimHei']

mpl.rcParams['axes.unicode_minus'] = False

path = '..\\8.Regression\\iris.data' # 数据文件路径

data = pd.read_csv(path, header=None)

x = data[range(4)]

y = pd.Categorical(data[4]).codes

# 为了可视化，仅使用前两列特征

x = x.iloc[:, :2]

x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(x, y, train_size=0.7, random_state=1)

print y_test.shape

# 决策树参数估计

# min_samples_split = 10：如果该结点包含的样本数目大于10，则(有可能)对其分支

# min_samples_leaf = 10：若将某结点分支后，得到的每个子结点样本数目都大于10，则完成分支；否则，不进行分支

model = DecisionTreeClassifier(criterion='entropy')

model.fit(x_train, y_train)

y_test_hat = model.predict(x_test) # 测试数据

# 保存

# dot -Tpng my.dot -o my.png

# 1、输出

with open('iris.dot', 'w') as f:

tree.export_graphviz(model, out_file=f)

# 2、给定文件名

# tree.export_graphviz(model, out_file='iris1.dot')

# 3、输出为pdf格式

dot_data = tree.export_graphviz(model, out_file=None, feature_names=iris_feature_E, class_names=iris_class,

filled=True, rounded=True, special_characters=True)

graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data)

graph.write_pdf('iris.pdf')

f = open('iris.png', 'wb')

f.write(graph.create_png())

f.close()

# 画图

N, M = 50, 50 # 横纵各采样多少个值

x1_min, x2_min = x.min()

x1_max, x2_max = x.max()

t1 = np.linspace(x1_min, x1_max, N)

t2 = np.linspace(x2_min, x2_max, M)

x1, x2 = np.meshgrid(t1, t2) # 生成网格采样点

x_show = np.stack((x1.flat, x2.flat), axis=1) # 测试点

print x_show.shape

# # 无意义，只是为了凑另外两个维度

# # 打开该注释前，确保注释掉x = x[:, :2]

# x3 = np.ones(x1.size) * np.average(x[:, 2])

# x4 = np.ones(x1.size) * np.average(x[:, 3])

# x_test = np.stack((x1.flat, x2.flat, x3, x4), axis=1) # 测试点

cm_light = mpl.colors.ListedColormap(['#A0FFA0', '#FFA0A0', '#A0A0FF'])

cm_dark = mpl.colors.ListedColormap(['g', 'r', 'b'])

y_show_hat = model.predict(x_show) # 预测值

print y_show_hat.shape

print y_show_hat

y_show_hat = y_show_hat.reshape(x1.shape) # 使之与输入的形状相同

print y_show_hat

plt.figure(facecolor='w')

plt.pcolormesh(x1, x2, y_show_hat, cmap=cm_light) # 预测值的显示

plt.scatter(x_test[0], x_test[1], c=y_test.ravel(), edgecolors='k', s=150, zorder=10, cmap=cm_dark, marker='*') # 测试数据

plt.scatter(x[0], x[1], c=y.ravel(), edgecolors='k', s=40, cmap=cm_dark) # 全部数据

plt.xlabel(iris_feature[0], fontsize=15)

plt.ylabel(iris_feature[1], fontsize=15)

plt.xlim(x1_min, x1_max)

plt.ylim(x2_min, x2_max)

plt.grid(True)

plt.title(u'鸢尾花数据的决策树分类', fontsize=17)

plt.show()

以上就是决策树做分类，但决策树也可以用来做回归，不说直接上代码：

if __name__ == "__main__":

N =100

x = np.random.rand(N) *6 -3

x.sort()

y = np.sin(x) + np.random.randn(N) *0.05

x = x.reshape(-1,1)

print x

dt = DecisionTreeRegressor(criterion='mse',max_depth=9)

dt.fit(x,y)

x_test = np.linspace(-3,3,50).reshape(-1,1)

y_hat = dt.predict(x_test)

plt.plot(x,y,'r*',ms =5,label='Actual')

plt.plot(x_test,y_hat,'g-',linewidth=2,label='predict')

plt.legend(loc ='upper left')

plt.grid()

plt.show()

#比较决策树的深度影响

depth =[2,4,6,8,10]

clr = 'rgbmy'

dtr = DecisionTreeRegressor(criterion='mse')

plt.plot(x,y,'ko',ms=6,label='Actual')

x_test = np.linspace(-3,3,50).reshape(-1,1)

for d,c in zip(depth,clr):

dtr.set_params(max_depth=d)

dtr.fit(x,y)

y_hat = dtr.predict(x_test)

plt.plot(x_test,y_hat,'-',color=c,linewidth =2,label='Depth=%d' % d)

plt.legend(loc='upper left')

plt.grid(b =True)

plt.show()

不同深度对回归的 影响如下图：

下面上个随机森林代码

mpl.rcParams['font.sans-serif'] = [u'SimHei'] # 黑体 FangSong/KaiTi

mpl.rcParams['axes.unicode_minus'] = False

path = 'iris.data' # 数据文件路径

data = pd.read_csv(path, header=None)

x_prime = data[range(4)]

y = pd.Categorical(data[4]).codes

feature_pairs = [[0, 1]]

plt.figure(figsize=(10,9),facecolor='#FFFFFF')

for i,pair in enumerate(feature_pairs):

x = x_prime[pair]

clf = RandomForestClassifier(n_estimators=200,criterion='entropy',max_depth=3)

clf.fit(x,y.ravel())

N, M =50,50

x1_min,x2_min = x.min()

x1_max,x2_max = x.max()

t1 = np.linspace(x1_min,x1_max, N)

t2 = np.linspace(x2_min,x2_max, M)

x1,x2 = np.meshgrid(t1,t2)

x_test = np.stack((x1.flat,x2.flat),axis =1)

y_hat = clf.predict(x)

y = y.reshape(-1)

c = np.count_nonzero(y_hat == y)

print '特征：',iris_feature[pair[0]],'+',iris_feature[pair[1]]

print '\t 预测正确数目：',c

cm_light = mpl.colors.ListedColormap(['#A0FFA0', '#FFA0A0', '#A0A0FF'])

cm_dark = mpl.colors.ListedColormap(['g', 'r', 'b'])

y_hat = clf.predict(x_test)

y_hat = y_hat.reshape(x1.shape)

plt.pcolormesh(x1,x2,y_hat,cmap =cm_light)

plt.scatter(x[pair[0]],x[pair[1]],c=y,edgecolors='k',cmap=cm_dark)

plt.xlabel(iris_feature[pair[0]],fontsize=12)

plt.ylabel(iris_feature[pair[1]], fontsize=14)

plt.xlim(x1_min, x1_max)

plt.ylim(x2_min, x2_max)

plt.grid()

plt.tight_layout(2.5)

plt.subplots_adjust(top=0.92)

plt.suptitle(u'随机森林对鸢尾花数据的两特征组合的分类结果', fontsize=18)

plt.show()

以上就是本文的全部内容，希望对大家的学习有所帮助，也希望大家多多支持脚本之家。