hpcc安装_【HPCC】上海大学“自强4000”简介

【HPCC】上海大学“自强4000”简介

        “自强4000”是我校第三代集群式高性能计算机,也是当前我校计算能力最强的集群式高性能计算机。

        “自强4000”于2013年6月建成并投入使用,其系统总运算峰值约70万亿次/秒(70Tflops),其中CPU双精度浮点运算峰值57152Gflops,GPU双精度浮点运算峰值14410Gflops,系统总体Linpack效率约为85%。

硬件配置

  • CPU计算节点140台,每台2颗Intel SandyBridge架构的E5-2690 CPU(2.9GHz/8-core)、64GB内存,共有2240核、8.96TB内存。

  • 胖节点2台,每台4颗Intel SandyBridge架构的E5-4650 CPU(2.7GHz/8-core)、512GB内存,共有64核、1TB内存。

  • GPU节点11台,每台2颗Intel SandyBridge架构的E5-2680 CPU(2.7GHz/8-core)、64GB内存,共计176核,每台2块NVIDIA M2090 GPU计算模块。

  • 系统内存总量:10TB。

  • 存储系统磁盘总量:180TB。

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系统及软件

     “自强4000”采用linux操作系统,作业调度软件采用Platform LSF,文件系统为GPFS。

      并行环境包括:Intel Cluster Studio软件工具包,提供Intel C/C++, Fortran Compiler编译器,Intel Math Kernel Library数学库,包含BLAS、LAPACK、Scalapack等,提供跟踪分析器和跟踪采集器;Intel MPI、OpenMPI、MPICH2和MVAPICH等并行编译环境。

       同时,中心购买了以下软件的版权并安装在“自强4000”上供用户使用:

  •  工程仿真软件ANSYS,

  • 材料结构设计模拟及性质计算软件Materials Studio,

  • 显式动力分析软件LS-DYNA,

  • 电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包VASP(license授权方式为6人小组授权), 

  • 电子结构模拟软件GAUSSIAN09, 

  • 多物理场仿真软件COMSOL Multiphysics, 

  • 电子结构量化计算软件MOLPRO等。

服务情况

“自强4000”为全校师生提供开放服务,以老师为单位申请账号,并且每位老师可申请一个账号供其研究团队共享使用。

目前,“自强4000”上已有191个用户账号,用户来自学校多个学院和研究所,包括材料学院,环化学院,理学院,计算机学院,通信学院,机自学院,材料基因研究院,力学所等等。

提供服务以来,“自强4000”已为学校145项科研项目提供支持,用户反馈的借助“自强4000”计算平台发表的高水平科研论文超过80篇。

目前,“自强4000”上的用户分为付费用户和免费用户。校内付费用户的收费标准暂定为0.08元每CPU核时,具有比免费用户更高的优先级,并可调度更多资源。关于收费细则和使用说明等资料可在中心网站上查阅(网址:www.hpcc.shu.edu.cn),欢迎大家使用“自强4000”集群式高性能计算机。

平台管理员:王洋、周丽萍、丁雪海

中心主任:沈文枫

中心成员:王洋、徐宝宇、周丽萍、丁雪海

中心网站:www.hpcc.shu.edu.cn

地址上海市宝山区南陈路333号,上海大学(东区)计算机学院一楼

Email: sc@department.shu.edu.cn

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高效能计算中心平台资源对外开放共享,提供计算资源和技术支持,欢迎校内外用户来中心进行交流、合作研究。

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