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每学期
校级计算平台总会迎来
一批新的可可爱爱
开开心心拿到账号
满怀憧憬准备使用超算集群
却发现
集群不会登、软件不会装
作业脚本不会写、文档不会看
别急,小编今天给大家分类汇总了
最常见、最基础的问题
助你轻轻松松上手超算集群
账号申请
Q:如何申请账号?
A:
第一步:完成新手上路测试
https://www.bilibili.com/video/BV1oK4y1x7AJ;
第二步:下载并填写申请表
https://net.sjtu.edu.cn/wlfw/gxnjsfw.htm;
第三步:将上述步骤中的截图和申请表发送至hpc邮箱。
Q: 课题组人数较多,一个账号不够用?
A:可以申请子账号。发送申请至 hpc邮箱,申请内容需包含自定义的子账号名,格式为xxx-yyy,其中xxx为主账号,yyy可以自定义,比如user1、user2。每个主账号下可以免费开通4个子账号,超出之后,每个子账号收取200元/年的管理费。
Q:医学院及附属医院如何申请?
A:需要先申请jAccount账号,然后再按照上述申请流程申请账号即可。jAccount账号申请方式:
https://www.shsmu.edu.cn/net/info/1054/1080.htm
Q:学生可以申请超算账号吗?
A:不可以。目前仅支持教职工(含博士后)申请,学生如果需要使用,可以联系导师申请。
集群登录
Q:常用的登录客户端有哪些?
A:1)Windows 客户端:putty、xshell。
2)Linux / Unix / Mac操作系统拥有自己的SSH客户端,包括ssh、scp、sftp。
Q: 为什么连不上集群?
A:1)本地网络不畅通。
2)多次输入密码错误会被临时封禁1小时。
3)在登录节点运行作业,被加入黑名单,在30-120分钟内无法登录。
4)请查看群公告、邮件、微信公众号是否有集群维护通知。
作业提交和运行
Q:单个作业最长运行时间是多长?
A:cpu small dgx2队列默认最长运行时间为7天,huge 192c6t队列最长运行时间为2天。
Q:如何延长作业运行时间?
A:如需延长可以发送邮件至hpc邮箱,最长可以延长至30天。
Q:作业运行结果是 node_fail 该怎么处理?
A:重新提交作业即可,失败作业的机时系统会自动返还。
Q:作业需要大内存怎么办?
A:目前集群有 huge 和 192c6t 节点可以提供较大的内存。huge节点每节点提供3TB内存,192c6t 节点可以提供6TB内存。
Q:作业显示AssocGrpNodeLimit是什么原因?
A:账号因欠费停机,需要尽快充值缴费。
Q:登录节点上哪些可以做?哪些不可以做?
A:允许编辑文件、提交作业、编译小型应用、下载文件等轻量级工作。
而对于科学计算、大规模编译等任务,不能在登录节点上运行,需要申请计算节点操作。
Q:如何申请计算节点?
A:1)salloc -p cpu -n 40 --exclusive(在CPU队列申请一个计算节点)
2)srun -p small -n 4 –pty /bin/bash (在small队列申请4核)
数据传输
Q:少量数据传输方式?
A:使用 putty、filezilla 等客户端,或在本地使用 scp、 rsync 命令向集群发起传输请求。
Q:大量数据传输(10TB-1PB)?
A:将硬盘等存储设备送至超算办公室传输,时间及地点请提前邮件沟通。
Q: 超大量数据传输(大于1PB)?
A:请将项目详细信息发给我们,我们会安排专员与您对接。
软件安装类
Q:如何在超算上安装开源软件?
A:使用module avail 查看已安装的软件,如未找到所需的软件信息,请发送邮件至 hpc邮箱获取帮助。
Q:如何在超算上安装商业软件?
A:在采购License之前,建议先与我们和厂商进行充分沟通,请注意:
1)不要把 License 绑定到Pi集群的登录节点;
2)请购买浮动授权;
3)询问厂商 License 服务器是否可以部署在虚拟机上;
4)与厂商充分沟通 License 服务器安装模式、授权数量、使用限制、更换MAC地址的费用以及厂商具备基本的技术支持能力。
Q:普通用户能否使用sudo安装软件?
A:不能,普通用户无法获得sudo权限。
Q:超算上是否提供matlab?
A:不提供。如需使用,建议在云平台上获取免费正版matlab软件,服务邮箱:cloudservice@sjtu.edu.cn。
充值缴费
Q:缴费流程?(校内及校外)
A:进入公众号,回复关键词“缴费”。
Q:在财务转账完成后,计费平台上还是显示欠费,该怎么办?
A:将财务凭证号以及需要充值的jAccount账号发送至许老师邮件lmxu@sjtu.edu.cn,手动充值。
Q:如何充值,可以自动到账?
A:在“我的数字交大—>流程—>财务—>校内转账”办理转账,可以自动到账。
Q:如何查询账户余额?
A:
方法一:“我的数字交大—>校园网—>计算费查询”
方法二:登录超算计费系统查询:
https://account.hpc.sjtu.edu.cn/#/login
平台培训
本学期用户培训预计在11月份举办,请大家及时留意公众号通知。
如有其他疑问,可发送邮件咨询
hpc@sjtu.edu.cn