2
)
反向互补:
“
Goodies
”
“
ReverseComplement
”
2
.
Seqman
(
1
)
“
Add sequence
”添加拼接序列,选中目标序列,
“
Add
”
、
“的
Done
”导
入目标序列
(
2
)
如果导入为峰图文件,
可双击文件名弹出峰图,
用黑分隔线去除测序质
量不好的区域(为黄色区域)
(
3
)修正后点击
Assemble
(拼接)
,若能拼接上,则在“
conting
”一栏显示
(
4
)双击“
conting
”可看到完整序列,以及两个峰图的重叠区域,若两个峰
图完全匹配,则拼接可靠
(
5
)点击菜单栏的
“
conting
”
“
saveconsensus
”
“
singleFile
”
保存拼接好的
序列
Seqman
去除载体
当插入到载体上的片段,在分析前需要先去除载体序列。
Trim sequence ends
Scam for vector
“
SetVector
”
,
选前后载体(两栏都要选)
“
optionptimire sequence assembly order
Don
,
t add single sequence
Congtigs
3
.
MegAlign
(1)
“
Flie
”
“
New
”
再点击“
File
”
“
Entersequence
”
添加需对比的序列,
“
add
”
“
Done
”
The Jotun Hein method
(2)
点击
“
Align
”
有三种比对方式
Clustal V
Clustal W
Onepair
先选中将要比对的两序列,选中“
Alimentcolor
”
“
vartioalsare
”选颜色