01. 引言
本期推文只要介绍学术散点图的绘制教程,涉及的内容主要还是matplotlib散点图的绘制,只不过添加了相关性分析,拟合关系式和颜色映射散点密度(大多数的英文文章中多出现此类图表)。首先我们看一下下面这幅图:
(图片来源于网络,如有侵权,望告知,删除,谢谢)
从该图可以看出,这是用ggplot2绘制的相关性散点图(别问我为啥,第一感觉就是
),需要的数据量极大且颜色代表了散点密度大小。下面我们就用python-matplotlib 进行此类相关性散点图的绘制教程。
02. 数据处理及可视化
数据我们选择两组相关性较高的的数据,假设一种为真实值,一种为模型预测值,结果如下(部分):
可视化绘制01:
可视化的绘制过程还是和之前的教程推文差不多,这里我们主要讲解新的内容,绘制完整代码如下:
解释如下:
(1)12-18行,使用numpy.linespace()和scipy的optimize.curve_fit()方法绘制拟合公式,并以此绘制散点拟合线和散点对角线;
(2)33-35行,主要针对对Axis设置刻度标签字体。绘图结果如下:
这类图表对一般的学术期刊,其完全符合要求,但如果散点更多,则需要用颜色映射进行散点密度映射,使读者更容易理解图表。
可视化绘制02:
针对颜色映射散点密度大小,主要步骤与上述相同,添加的额外代码如下:计算密度范围并附上颜色:
# Estimate the 2D h