用途:
生信分析相关图主要目的是生物数据的可视化。 更准确地说,将有助于将表达数据与功能分析的结果进行合并和整合。其本质不能用于执行任何这些分析,仅用于可视化目的。
上代码:
#按照R包install.packages('GOplot')#也可以直接通过网站按照最新的install_github('wencke/wencke.github.io')# 调取R包library(GOplot)#数据读取,自己的数据可以用datadata(EC)# 展示部分结果head(EC$genelist)
结果1:
## ID logFC AveExpr t P.Value adj.P.Val B
## 1 Slco1a4 6.645388 1.2168670 88.65515 1.32e-18 2.73e-14 29.02715
## 2 Slc19a3 6.281525 1.1600468 69.95094 2.41e-17 2.49e-13 27.62917
## 3 Ddc 4.483338 0.8365231 65.57836 5.31e-17 3.65e-13 27.18476
## 4 Slco1c1 6.469384 1.3558865 59.87613 1.62e-16 8.34e-13 26.51242
## 5 Sema3c 5.515630 2.3252117 58.53141 2.14e-16 8.81e-13