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2019年12月18-20日
广州天一酒店
老师现场讲解,课后答疑解惑
报名方式请查看末页
课程特色 1、科学设计课程,由浅入深,从基础命令到复杂统计和高阶绘图,直击生物医学数据挖掘中的关键操作。 2、三天时间高强度集中训练,以实际项目为案例,全程上机实操,完全重现高分文章中的关键图表。 3、赠送32G优盘和纸质版讲义一份,内含大量学习资料,供课后复习巩固。 4、建立专属学员微信群,课前专业助教协助安装软件,课后讲师长期群内随时答疑,不定期推送技能提升小教程,帮助学员轻松应对R语言应用中的常见难题。 5、我们承诺:学员一次报名,终生免费复学此门课,无需担心学不会、学不精,只要您愿意学,唯誉保证教会您。我们坚信,这是目前最好的R语言培训班了!!!
课程简介2019年12月18-20日期间,VeryGenome在广州举办“R语言统计绘图与生物医学数据挖掘实战培训班”,全程上机操作,配助教1-2名,主要讲授R语言统计、绘图及生物医学课题相关数据挖掘的操作,目标是使没有R语言基础的学员在学习后能独立进行R相关的统计、绘图及数据挖掘分析操作。
主讲老师简介 985高校一线科研团队 ,团队成员有着五年以上生物信息分析经验,擅长R、Perl、Python等编程语言,在多组学生物大数据分析方面有着丰富的经验。课程安排日期 | 时间 | 课程 | 内容 |
12月18日 | 上午9:00-12:00 | R语言基础知识介绍 | R语言简介 |
R语言环境搭建 | |||
进入R语言环境 | |||
退出R语言环境 | |||
R语言路径操作 | 工作目录查看 | ||
工作目录设置 | |||
R语言文件及文件夹操作 | 子目录查看 | ||
文件列表文件 | |||
创建文件 | |||
合并文件 | |||
复制文件 | |||
重命名 | |||
删除文件 | |||
创建文件夹 | |||
删除文件夹 | |||
R语言对象操作 | 变量属性:字符、数字、整数、符合、逻辑 | ||
变量特征:名称、长度 | |||
变量类型:数组、向量、矩阵、数据框、列表 | |||
向量操作:赋值、向量合并、向量长度、变量查看、变量删除、 | |||
矩阵操作:按列合并、按行合并、查看开头数据、查看末尾数据、查看结构、查看行列数、查看指定行列、替换指定行列、对列赋值、对行赋值、建立矩阵 | |||
数据框操作:数据框建立、按名字查看某一列、查看行数、查看列数 | |||
列表操作:建立列表 | |||
R语言数据读写操作 | 表格数据读取 | ||
文本文件读取 | |||
压缩文件读取 | |||
网页文件读取 | |||
R数据保存 | |||
R工作空间保存 | |||
R语言内存操作 | 查看内存项目 | ||
删除内存项目 | |||
查看历史命令 | |||
R内存管理 | |||
R语言R包操作 | 安装R包 | ||
加载R包 | |||
引用R包 | |||
获取R包帮助 | |||
Bioconductor的使用 | |||
下午14:00-18:00 | R语言运算操作 | 加法 | |
减法 | |||
乘法 | |||
除法 | |||
幂运算 | |||
求余 | |||
整除 | |||
包含判断 | |||
取对数 | |||
R语言基础统计 | 特殊字符及缺失值处理 | ||
求和 | |||
求平均值 | |||
求最大值 | |||
求最小值 | |||
求中位数 | |||
排序 | |||
求方差 | |||
R语言统计操作 | 求标准差 | ||
分布特征 | |||
相关分析 | |||
聚类分析 | |||
参数估计 | |||
假设检验 | |||
方差分析 | |||
回归分析 | |||
主成分分析 | |||
卡方拟合优度检验 | |||
Wilcoxon秩和检验 | |||
Spearman等级相关分析 | |||
Kruskal-Wallis方差分析 | |||
线性回归 | |||
Logistic回归 | |||
12月19日 | 上午9:00-12:00 | R语言编程基础 | which函数 |
if和if else函数 | |||
for函数 | |||
while函数 | |||
repeat函数 | |||
next函数 | |||
nchar函数 | |||
tolower函数 | |||
toupper函数 | |||
chartr函数 | |||
paste函数 | |||
grep函数 | |||
grepl函数 | |||
sub函数 | |||
gsub函数 | |||
substring函数 | |||
正则表达式 | |||
R语言函数及脚本编写 | 默认参数函数 | ||
无默认参数函数 | |||
非必须参数函数 | |||
参数传递 | |||
命令行传递参数 | |||
实例:生物数据处理函数的编写 | |||
实例:生物数据处理脚本的编写实例 | |||
R包开发 | R包开发工具 | ||
R包开发流程 | |||
实例:生物数据R包的编写 | |||
下午14:00-18:00 | R语言绘制常用图像 | 条形图 | |
折线图 | |||
散点图 | |||
直方图 | |||
饼图 | |||
箱线图 | |||
小提琴图 | |||
曼哈顿图 | |||
火山图 | |||
韦恩图 | |||
词云图 | |||
热图 | |||
地图 | |||
圈图 | |||
R图像调整 | 图像形状调整 | ||
图像颜色调整 | |||
图像组合 | |||
12月20日 | 上午9:00-12:00 | 数据挖掘基础 | 数据抽样 |
数据生成 | |||
数据清洗 | |||
数据降维 | |||
机器学习 | KNN分类 | ||
朴素贝叶斯分类 | |||
决策树分类 | |||
神经网络 | |||
支持向量机 | |||
K均值聚类 | |||
数据挖掘操作 | 网络爬虫 | ||
模型性能评价 | |||
集成学习:bagging、Boosting、随机森林 | |||
下午14:00-18:00 | R语言基因组与系统进化分析 | 序列长度分析 | |
GC含量分析 | |||
ORF分析 | |||
ORF蛋白序列预测 | |||
核酸序列遗传距离计算 | |||
蛋白质序列遗传距离计算 | |||
系统发育树可视化 | |||
R语言转录组分析 | 基因注释及ID转换 | ||
差异基因筛选 | |||
差异基因可视化 | |||
GO分析与可视化 | |||
KEGG分析可视化 | |||
GSEA分析可视化 | |||
共表达网络分析 | |||
R语言代谢组分析 | 代谢峰提取与比对 | ||
离子峰注释 | |||
代谢峰鉴定 | |||
代谢物谱图可视化 | |||
下午14:00-18:00 | R语言分析实战 | 一篇高分文章的图表完全重现 |
VeryGenome 广州市唯誉智合科技有限公司
时间地点2019年12月18-20日
广州天一酒店
地址:广州市海珠区同福东路644号。(地铁2号线市二宫地铁站D出口)
注册费用3500元/人,按缴费顺序安排座次,注册费包含会场、讲义资料、午餐等费用,不含住宿费。
优惠策略:
1、学生(凭学生证)减100元。
2、三人(含)以上团体每人减100元。
3、11月30日(含)之前缴费每人减100元。
4、以上优惠可叠加。
5、必须现场刷公务卡的提前支付宝或微信转500元定金算提前缴费(定金刷卡时退还)。
住宿安排广州天一酒店
地址:广州市海珠区同福东路644号。(地铁2号线市二宫地铁站D出口)
标准间/单间:358元/间/晚(含早餐、含宽带)
备注:住宿费用自理,不作规定,办理住宿时告知前台是参加此学习班的即可,住宿费办理住宿时交给酒店前台,住宿费发票将在退房时由酒店开具给您。
培训须知1、报到时间12月17日17:00-20:00或12月18日早上8:00-8:50,在酒店四楼大厅报到领取资料,12月17日20:00之后到达酒店的请务必提前联系客服(手机:13829733579)预留房间。
2、培训含统一午餐,住宿及其他费用自理。
3、上课时间为12月18日-20日每天上午9:00-12:00,下午14:00-18:00。
4、培训需自备电脑(建议Windows系统)、鼠标。
5、教学使用的软件为R3.6.1,软件资料及安装手册会提前一周发放,安装问题课上老师会讲解,如果有R语言相关问题,可与授课老师当场交流。
报名入口1、请务必留意培训主办单位为“广州市唯誉智合科技有限公司”及会议日期(12月18-20日)地点(广州),以免弄错。
2、您发送报名信息后会收到我们更详细的报到通知等说明,如未收到或有任何疑问可直接拨打客服电话 13829733579。
缴费方式缴费方法一:企业银行转账
开户行:中国工商银行广州中山大学支行
户名:广州市唯誉智合科技有限公司
银行账号:3602 8648 0910 0082 246(转账请去除空格)
备注请写明:单位+姓名+R语言,以便于核实
少数单位转账需银行行号:1025 8100 4113
缴费方法二:支付宝转账支付宝收款账户:service@verygenome.com
请核对户名:广州市唯誉智合科技有限公司
备注请写明:单位+姓名+R语言,以便于核实
缴费方法三:现场刷卡、现金、微信支付
备注1、发票会在会议期间发放,根据规定需要提供贵单位税号,请务必参会前问好贵单位税号;随发票一同发放的还有经过盖章的纸质版会议邀请函,以便于大家报销费用时作为会议凭证。
2、如需请款,您报名后会发送经盖章的PDF版本的邀请函,打印出来用于财务请款,某些单位需要现场刷公务卡的请报名时加以备注。
3、老学员复听不再安排午餐及资料,请提前联系课程助教协助报名。
常见问题微信客服