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原创 设置国内的源加快R包下载速度
绝大部分的生物信息相关的R包(如DESeq2, limma, clusterProfiler)都在 bioconductor,并不在官方的源里面,所以通过 install.packages() 命令会找不到对应的R包。但是官方的源并不在中国,下载速度往往会受到很大的限制,因此当我们安装好R之后,第一步就应该是把R的安装源修改为国内的源(也称镜像,Mirror)。安装package的时候,默认会在官方的源(https://cran.rstudio.com/)搜索R包,然后下载到你的电脑或者。
2024-01-30 16:56:36 311 1
原创 Linux shell获取某一行中指定字符前后的内容
比如有个abc.txt文件,里面有很多行内容,其中有行内容为ro.xxx=123,要想获取到123这个值,可以如下处理。## awk -F '=' 的意思是以=为分割,将字符串串分成两部分,通过$1,$2可以引用这两部分。
2024-01-30 09:21:55 413
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