《Fast graph representation learning with PyTorch Geometric》阅读笔记【PyG-paper】

这篇文章是PyG的官方paper,里面提供了很多有价值的信息,在这里进行一下汇总和思考。

Fey M, Lenssen J E. Fast graph representation learning with PyTorch Geometric[J]. arXiv preprint arXiv:1903.02428, 2019.

PyG主要是利用消息传递框架的思想来「提供API接口」以及「实现高GPU吞吐量」(加速)的。

图数据结构

G = ( X , ( I , E ) ) , X ∈ R N × F , I ∈ N 2 × E , E ∈ R E × D G=(X,(I,E))\quad ,X\in R^{N\times F},I\in N^{2\times E},E\in R^{E\times D} G=(X,(I,E)),XRN×F,IN2×E,ERE×D
X就是我们常说的节点特征矩阵data.x,I是之前见过的COO格式的边索引表data.edge_index,E是边的特征矩阵(在节点分类任务中用不到)。当然,I也可以表示成SpareTensor的形式,这个后面也会说什么时候需要用到这种形式。

消息传递框架MPNN

x i ′ = γ ( x i , □

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