配准
文章平均质量分 87
毛毛Timmy
投资小白,不定期分享些投资经验总结与心得,偶尔分享些技术。
展开
-
硕士研究生读研经验总结篇--以配准研究为例
前言受疫情影响,一切人群聚集的活动都被取消或推迟了。我们的毕业典礼原应该像以往一样,让人兴奋、迷惘、庄严而又不舍,但这次却悄无声息。这突如其来的疫情,一直顽强蔓延至今,近期仍有大面积反弹风险。受此影响,我的母校始终未让毕业生一起返校,也没有举行毕业典礼,没有任何形式的活动。我们只能草草收拾东西,退宿,踏入工作岗位,甚至不能和班上的同学好好道个别,更别提合拍毕业证了。我对此一直很遗憾,总想以某种形式总结下研究生阶段的经历,纪念一下。在科研方面,我一直想总结一下,本着知识分享的精神,给大家分享一下我的研究生原创 2020-06-27 00:15:36 · 4697 阅读 · 11 评论 -
【开源计划】图像配准中变形操作(Warp)的pytorch实现
前言按照开源计划的预告,这次我来分享图像配准流程中的变形操作的代码实现。首先我们先来回顾一下配准的流程,我们以这篇Unsupervised End-to-end Learning for Deformable Medical Image Registration论文中的流程图为例,进行说明。该论文提出的配准框架是基于无监督学习的端到端的非刚性图像配准,配准网络(registration ne...原创 2020-03-17 23:15:32 · 9407 阅读 · 19 评论 -
【开源计划】图像配准中常用损失函数的pytorch实现
前言按照开源计划的预告,我们首先从基于深度学习的图像配准任务中常用的损失函数的代码实现开始。从我最开始的那一篇博客,即基于深度学习的医学图像配准综述,可以看出,目前基于无监督学习的图像非刚性配准模型成为了一个比较流行的研究方向。这是因为基于监督学习的方法过分依赖传统方法或者模拟变形的方法来提供监督信息,这样既吃力又不讨好。以我的探索经验来讲,以传统配准方法产生的变形场作为监督信息,对网络进行训...原创 2020-03-16 18:55:51 · 6264 阅读 · 8 评论 -
【开源计划预告】医学图像非刚性配准实践项目开源计划(5-5更新)
前言疫情当前,全国人民都被禁足在家,对我们的生产生活可谓影响至大。按计划我的研究生生涯即将结束,最近刚在线完成了毕业答辩,还剩下一些离校事宜。回顾这两年多的研究生经历,感慨良多,有积极的,更多的是消极的,不免对即将踏入的社会生活感觉到一些畏怯,对茫茫未来的担忧。闲言少叙,回顾我的科研课题--基于深度学习的医学图像快速配准方法研究--的研究历程,还是有一些成就感的,总算是交了差。从最初接触这...原创 2020-02-29 17:04:15 · 5236 阅读 · 19 评论 -
配准中雅可比行列式(Jacobian determinant)的原理、意义、代码实现以及可视化(5.14更新)
2019-5-14更新最近两天我研究了一下雅可比行列式的问题,重新检查了别人的公开代码与可视化,发现了一些问题,现总结如下:检查雅可比行列式的计算原理与其代码实现,我发现之前的代码存在问题,现在进行更新纠正; 关于其代码实现,我还有一个疑问没有解答,这可能与其数学原理有关,需要进一步的验证; 对雅可比行列式的计算结果进行可视化,本文提供了代码参考,并进行了解释,但还没解决。1.正确的代...原创 2019-02-19 11:09:07 · 13306 阅读 · 24 评论 -
plt.contour 绘制图像形变场(Deformation Field)(更新)
2019-3-17 更新第一次写博客,写得不够好,还存在一些问题,而且仅提供了一个函数,没有测试代码,在此做一下纠正与补充。我之前写的绘制变形场是在PyTorch框架下的一个函数,对于其他框架的不够友好,这次我修改成使用numpy的函数,方便大家使用。下面直接奉上修改后的代码:import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npdef...原创 2018-11-19 21:56:05 · 11184 阅读 · 29 评论 -
基于深度学习的医学图像配准综述(2020-6-25更新)
2019-6-21 更新没想到我的一篇深度学习做配准入门级的综述,竟然炸出来了这么多配准小白,甚是惊讶!我相信大家的初衷是一样的,都是为了交流学习配准而来。配准是个复杂的问题,刚开始接触这个,我也很迷茫,不知道从何下手,不清楚配准到底是什么样的,怎么实现的。完成本科的教育之后,我仅仅对配准有一个粗略的印象,对配准的算法细节更是一窍不通。虽然我的本科毕设做的就是配准,但当我的硕士导师询问我具体的细...原创 2019-05-07 10:27:19 · 48233 阅读 · 132 评论