fengzhibifang-CSDN博客

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2019-03-24 10:58:22 2993 1

原创哺乳动物胚胎发育过程中依赖H3K9me3的染色质重编程

哺乳动物胚胎发育过程中依赖H3K9me3的染色质重编程Reprogramming of H3K9me3-dependent heterochromatin during mammalian embryo developmentResult1 小鼠配子和早期胚胎中H3K9me3的全基因组特点 Fig1b The UCSC genome browser view of...

2018-09-11 18:27:15 5031

翻译小鼠植入前胚胎的可接近染色质图谱

Result1 小鼠植入前胚胎的可接近染色质图谱2 开放染色质的allelic图谱3 TESs和重复序列的可接近染色质4 早期胚胎发育的调控网络5 minor ZGA 过程中一种不同寻常的松散染色质状态Result1 小鼠植入前胚胎的可接近染色质图谱 Schematic of ATAC-seq and CARM for probing access...

2018-09-11 18:24:20 1429

转载（转载）ChIP-seq阴阳-正负对照

关于对照说到实验设计就不得不提到对照。从小老师教育我们，没有对照组的实验是不完整的，或者说就没有任何意义。所有的生化湿实验都很讲究完整的正对照和负对照。当然，下面的实验我都没做过。。。蛋白相关实验真真假假的事情太多。要把蛋白和已知相关的蛋白放在一起, 和已知不相关的放在一起, 检验实验手段是否能够区分这两种情况。所谓的正负对照，就是告诉别人我这个实验本身做的没问题。如果再往下做还要通过移除...

2018-09-11 18:07:24 4301

原创 ChIP-seq 数据分析

1 ChIP-Seq技术1.1 概念1.2 ChIP-seq技术原理2 ChIP-Seq数据分析2.1 数据下载2.2 质量控制（data_assess）2.2.1 质量评估2.2.2 清理 reads2.3 比对到参考基因组（mapping_analysis）fastq→sam→bam（H3K9me3 在全基因组的分布位置）2.4 搜峰（Peak_callin...

2018-09-11 18:04:46 39691 1