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原创 Boosting 系列算法——1. 简单概述
写在最前博主准备写几篇博客，主要将目前比较常见的一些Boosting算法进行汇总整理，帮助大家更好的进行机器学习算法的学习。同时对将来找工作的童鞋们也能有一些帮助。本系列博客参考了大量网上的内容（包括Wiki，中英文博客等），涉及到的相关Boosting算法的原始论文，以及李航老师的《统计学习方法》，三位大牛的《The Elements of Statistical Learning》，还有周志华老师的《集成学习》。为了方便大家对整个Boosting算法的理解，并且处于严谨的考虑，这一系列博客都将采用
2020-12-19 10:39:43
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原创 利用Python进行百度文库内容爬取（一）
新手上路在很多时候我们需要下载百度文库内容的时候，弹出来的是下载券不足，而现在复制其中的内容也只能复制一部分，如果遇到一些政治开卷考，考前抱佛脚，想要复制出文库中的内容，可谓是难上加难。对百度文库内容的获取，从最开始的大部分文档可以免费直接从中直接下载，到后面需要通篇复制下来，再到后来的只能一小句一小句的复制，获取起来非常难受。这时可以对想要获取的内容直接涂黑，然后右键“搜索”，即可将想要...
2018-07-14 19:38:27
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原创 ggplot2：初次见面，请多多关照！
序作为一枚统计专业的学僧，首先需要掌握的编程语言一定是R。虽然自己对R谈不上精通，但却有着不一样的热爱，尤其热衷于使用R语言绘制各种各样觉得十分酷炫的图。每每磕完一个绘图作品，仿佛过了一个愉快的寒暑假，充实而满足。而在R语言中，谈到绘图，就不得不聊聊ggplot2这个大神器。刚开始接触学习的时候，其实是非常抵触，觉得非常非常难的，但随着一张张图片跃然于屏幕之上，心中的抵触满满消失，取而代之...
2018-03-31 19:37:56
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原创 Markdown 如何自动给长代码块添加滑动条 / 文本选择性隐藏
Markdown 如何自动给长代码块添加滑动条 / 文本选择性隐藏当用 Markdown 进行文档编辑时，遇到长代码或者长文本无法进行展示，这时我们就可以用如下两种方式，让我们的长文本仅占一个小区间进行展示。方式一：自动给长代码块添加滑动条直接在 .md 文件的最开头（也可以是任意地方）添加下述语句即可：<style>pre { overflow-y: auto; max-height: 300px;}</style>而后我们分别用代码框展示一个长的与短的
2022-05-24 22:51:53
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原创 图机器学习——5.11 图神经网络：网络训练与数据集划分
网络训练整体的训练可以分为基于有监督的标签训练，及无监督的训练。有监督训练可以有如下标签：基于节点标签yvy_vyv：如引文网络中，节点属于哪个学科领域；边标签yuvy_{uv}yuv：如交易网络中，边缘是否欺诈；图标签yGy_{G}yG：如分子图中，图的药物相似度。无监督训练：节点水平yvy_vyv：如聚类系数、PageRank、…；边水平yuvy_{uv}yuv：如隐藏两个节点之间的边，预测是否应该有链接；图水平yGy_{G}yG：如预测两个图是否同构。为
2022-05-24 22:28:01
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原创 图机器学习——5.10 图神经网络：预测任务
首先回顾一下整个GNN的结构，前面我们所介绍的都是红色框内所解决的任务。最终得到的节点嵌入结果，是一个关于每个在LLL层节点嵌入的集合：{hv(L),∀v∈G}\left\{\mathbf{h}_{v}^{(L)}, \forall v \in G\right\}{hv(L),∀v∈G}下面来我们来介绍图网络里，蓝色框中的预测任务（prediction head），其中包括：节点水平、边水平、图水平的三种预测：① 节点水平预测节点水平的预测我们可以直接采用最终的嵌入结果。也可以再进行一
2022-05-23 17:20:58
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原创 图机器学习——5.9 图神经网络：图的增广
由于在实际的训练中，原始的图结构往往不是训练的最优图结构。下面我们考虑如何对图进行增强（graph augmentation），这个类似于数据扩增，提升训练效率，模型的泛化能力及测试集的准确率。这种图增强的方法分为两种类型:图特征增强；图结构增强。需要图增强的原因有如下几点：输入图的节点可能比较缺乏特征；图结构可能过于稀疏，从而没有足够的信息传递；图结构可能过于稠密，进而导致信息传递出现冗余；图可能过大，使得一整个图结构没办法直接放入GPU中进行训练。针对上面几点，分别针对性地给出
2022-05-23 17:17:05
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原创 图机器学习——5.8 图神经网络：网络层连接
正常的图神经网络叠加应该是如下图所示，直接前一层的输出接后一层的输入。但这样简单的连接会出现 over-smoothing 的问题，即：所有的节点嵌入收敛到相同的值。这显然是不合理的。出现这种现象的原因如下。首先引入一个新概念——接受域（Receptive field），其决定一个感兴趣节点嵌入的一组节点。在K层GNN中，每个节点都有一个K阶邻居的接受域。下图分别为1-3阶邻居示意图：当我们增加邻居的阶数（GNN层数）时，共享邻居个数会快速增长，两个邻居节点的接受域会有非常多重合的邻居结点。回
2022-05-23 17:13:59
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原创 图机器学习——5.7 图神经网络：应用技巧与结构设计
对于一个网络的整体设计，现在常用的图神经网络借鉴了很多深度学习中的结构，包括：Batch Normalization：使训练过程更稳定；Dropout：减轻网络的过拟合；Attention/Gating：控制message的重要性；其他。下面进行详细说明。① Batch Normalization给定一批输入（节点嵌入），Batch Normalization 的作用是：重新中心化节点嵌入；重规范化方差。第一步：计算N个嵌入的均值与方差：μj=1N∑i=1NXi,jσj2=1N∑i=1
2022-05-23 16:59:05
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原创 图机器学习——5.6 广义 GNN 框架：GCN、GraphSAGE与GAT
① 图卷积网络（Graph Convolutional Networks，GCN）其核心结构为：hv(l)=σ(W(l)∑u∈N(v)hu(l−1)∣N(v)∣)\mathbf{h}_{v}^{(l)}=\sigma\left(\mathbf{W}^{(l)} \sum_{u \in N(v)} \frac{\mathbf{h}_{u}^{(l-1)}}{|N(v)|}\right)hv(l)=σ⎝⎛W(l)u∈N(v)∑∣N(v)∣hu(l−1)⎠⎞因此对应的 message 为（利
2022-05-23 16:53:22
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原创 图机器学习——5.5 广义 GNN 框架：消息传递与聚合
5. 广义视角下的 GNN 框架GNN 层的本质为：消息（Message） + 聚合（Aggregation）。在这一视角下的有许多不同的实例：GCN，GraphSAGE，GAT等，下面我们将着重讲解这三个不同的实例。GNN 的总体框架分别包括：1）消息 与 2）聚合，也就是一个网络层中的操作。3）层与层之间的连接4）图增广（Graph augmentation） 与 5）学习目标（Learning Object）下面我们一部分一部分进行分析。1）消息（Message）图网络中的
2022-05-23 16:31:02
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原创 图机器学习——5.4 图神经网络：另一种视角下的GCN
另一种视角下的GCN传统的卷积本质上就是一种加权求和方法。这种方法是针对图像或者视频数据中像素点（pixel）是排列整齐的矩阵进行处理，但遇到非欧结构中的拓扑图数据便无法进行计算。而在图卷积中，考虑的内容与之类似，核心思想为：图中的每个结点无时无刻不因为邻居和更远的点的影响而在改变着自己的状态直到最终的平衡，关系越亲近的邻居影响越大。（其实前面学习的embedding就是类似的思想）GCN方法又可以分为两大类，1. 基于空间（spatial-based）； 2.基于频谱（spectral-based）
2022-05-23 16:20:39
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原创 图机器学习——5.3 图神经网络：GNN与CNN及Transformer的关系
以上就是GNN的基本框架，下面我们来看看GNN与CNN框架及Transformer中的异同。1）GNN vs. CNNCNN层与层之间的传递公式为：hv(l+1)=σ(∑u∈N(v)∪{v}Wlu hu(l)),∀l∈{0,…,L−1}\mathrm{h}_{v}^{(l+1)}=\sigma\left(\sum_{u \in \mathrm{N}(v) \cup\{v\}} \mathrm{W}_{l}^{u} \mathrm{~h}_{u}^{(l)}\right), \quad \f
2022-05-23 16:07:36
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原创 图机器学习——5.2 图神经网络：GNN的构建与训练
1. GNN的构建我们将节点的邻居定义为可计算的图，图神经网络的主要想法是：每一个节点可以从周围的邻居中汇聚信息，而这个汇聚的方式就是通过神经网络来进行。以下图为例，我们来进行解释：首先以节点A为目标节点，其邻居为B, C, D，那么A的信息就由B, C, D进行汇聚；接着进行递归，B的信息来源于A, C（由于是无向图，因此A也需要进行考虑，下面类似）；C的信息来源于A, B, E, F；D又来源于A。因此得到上右图所示的网络。接着我们考虑所有的节点，均作为目标节点，构建一个这样的传递模型。这种
2022-05-23 15:38:40
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原创 图机器学习——5.1 图神经网络：GNN初步介绍
图神经网络（Graph Neural Network，GNN）下面我们开始介绍一个图机器学习中非常重要的部分——图神经网络（Graph Neural Network，GNN）。后面这一整个大部分的内容，也主要参考：CS224W: Machine Learning with Graphs.1. 符号定义假设我们已知图GGG包含下述信息：图中所有的节点集合（vertex set）：VVV；邻接矩阵（adjacency matrix）：A\boldsymbol{A}A；节点特征（node feat
2022-05-23 15:30:39
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原创 为什么不能说“接受原假设”？
我们主要从几个方面来说明，当统计中假设检验不显著时，为什么需要说 **不拒绝原假设** 而不能说 **接受原假设** 。
2022-04-10 16:20:52
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原创 图机器学习——4.3 节点分类：Correct & Smooth （C&S）
Correct & Smooth （C&S）1）方法介绍如今，图神经网络（GNN）是图学习方面的主要技术，在很多图结构相关的预测任务上取得了最顶尖的成绩，但在节点分类任务上，Correct & Smooth （C&S）可谓异军突起，通过基础浅层模型和“矫正”与“光滑”两个基于标签传播的后处理步骤即可达到甚至超越当前主流 GNNs 模型的性能，并且参数量和训练及运行时间远低于复杂的 GNNs 结构。下图为截至当前（2021/11/21）最顶尖的图中的节点分类方法排名，数据
2021-12-05 22:42:13
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原创 图机器学习——4.2 节点分类：迭代分类
迭代分类（Iterative classification）1）方法介绍为了解决关系分类没有考虑节点自身特征的问题，迭代分类方法被提出。输入为一个图：fvf_{v}fv 为节点 vvv 的特征，其为向量形式部分有标签的节点 vvv 对应标签为 YvY_{v}Yv节点 vvv 的邻居节点集合记为 NvN_vNv。方法核心思想为训练两个分类器，而后再利用分类器去迭代预测节点标签：ϕ1(fv)=\phi_{1}\left(f_{v}\right)=ϕ1(fv)= 基于节点特征 f
2021-12-05 22:30:54
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原创 图机器学习——4.1 节点分类：关系分类
利用信息传递进行节点分类现在我们来关注图网络中的节点分类问题。问题假设为：对于一个图，部分节点已知有标签（label）信息，另一部分没有标签信息，那么我们需要如何利用已知节点信息，来预测未知节点信息？如上图所示，绿色与红色节点已知的节点标签信息，我们需要对灰色的节点进行预测。这类问题被称为半监督节点分类（semi-supervised node classification）。在实际中，有很多场景都需要用到图分类模型，包括不局限于：文件分类；部分语音标记；链接预测；光学字符识别；图像/3D
2021-12-05 22:25:49
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原创 图机器学习——3.2 PageRank 算法问题改进与延伸
1. PageRank 算法问题与改进PageRank 算法在实际迭代过程中会遇到两个问题：死节点（dead ends）产生此问题的原因是有些节点没有向外的连接，如下图的bbb，那么就会导致最终重要性得分会变成0.出现此问题后不满足列和为1的假设，最终求解会出现问题。局部陷阱（spider traps）这种问题是由于所有的往外的连接都在一个小的组内，最终这个“陷阱”会吸收掉所有的重要性，如下图的bbb所示。这个问题在数学本身的求解上并不是问题，但出现局部陷阱后得到的并不是我们所期望
2021-12-05 22:14:48
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原创 图机器学习——2.3 整图嵌入
整图嵌入整图嵌入的想法是将一个完整的图结构嵌入为一个向量。通常有如下三种做法：1）节点嵌入求和一种非常简洁且有效的图嵌入方式是将图所有节点的嵌入结果进行求和或平均（Duvenaud et al., 2016）：zG=∑v∈Gzv\boldsymbol{z}_{\boldsymbol{G}}=\sum_{v \in G} \boldsymbol{z}_{v}zG=v∈G∑zv2）虚拟节点另一种比较简单的想法是将一个子图结构作为一个虚拟节点，而后运行前文叙述的标准节点嵌入算法（Propos
2021-11-22 12:26:29
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原创 图机器学习——2.2 节点嵌入：基于矩阵分解 及 节点嵌入的局限性
1. 节点嵌入——基于矩阵分解的方法我们得到的所有节点嵌入全部排列到一起，就构成了我们的嵌入矩阵Z\mathbf{Z}Z：每一列zi\mathbf{z_i}zi代表一个节点的嵌入，其为列向量。当vvv与uuu为邻居节点时，我们优化目标是最大化zvTzu\mathbf{z}_{v}^{\mathrm{T}} \mathbf{z}_{u}zvTzu（也就是使余弦相似度尽可能大）。由于我们已经对嵌入进行归一化，因此zvTzu\mathbf{z}_{v}^{\mathrm{T}} \mathbf{z}_
2021-11-22 12:23:54
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原创 图机器学习——2.1 节点嵌入：基于随机游走
嵌入（embedding）方法是目前文本分析，知识图谱相关中非常常见的一种算法。其为表示学习的一类方法，可以自动地从数据中学习“有用”的特征，并可以直接用于后续的具体任务。后面学习的相关嵌入学习均为表示学习中的内容。节点嵌入关于图的一些信息如何能够转化为计算机可以识别的语言呢？通常的方法也是进行嵌入（embedding）。在此之前，我们已经学习了双曲嵌入：双曲嵌入深度学习双曲嵌入论文与代码实现——1. 数据集介绍双曲嵌入论文与代码实现——2. 方法与代码其将图结构嵌入到双曲空间中而后根据双曲
2021-11-22 12:18:26
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原创 图机器学习——1.3 传统方法：基于图
基于图我们的目的是将整张图量化为一个特征，这里传统的做法是利用 Graph Kernel 来衡量两个图的相似度。图中的Kernel我们进行如下的定义：Kernel K(G,G′)∈RK\left(G, G^{\prime}\right) \in \mathbb{R}K(G,G′)∈R 衡量数据之间的相似性。存在一个特征表示 ϕ(⋅)\phi(\cdot)ϕ(⋅) such ，使得 K(G,G′)=ϕ(G)Tϕ(G′)K\left(G, G^{\prime}\right)=\phi(G)^{\mathr
2021-11-07 22:32:55
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原创 图机器学习——1.2 传统方法：基于边
基于边基于边的方法主要目的是预测节点与节点之间的边是否有连接。最简单的做法是对每个节点对进行评分，评分越高则越可能有边相连接（如距离的相反数）。而具体基于边的特征则包括：基于距离的特征（Distance based features）；局部相邻重叠（Local neighborhood overlap）；全局相邻重叠（Global neighborhood overlap）。a. 基于距离的特征此方法直接使用两个节点之间的最短路径长度，如下图所示，点与点之间的距离直接用途径边的条数进行表示。这种方
2021-11-07 22:27:17
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原创 图机器学习——1.1 传统方法：基于节点
本系列博客将围绕斯坦福大学的CS224W课程——图机器学习（Machine Learning with Graphs）。课程主页：http://web.stanford.edu/class/cs224w/博客中相关的图片基本来源于课程PPT。对于图的一些基本概念，这里不再进行详细的说明与解释，大家可以直接百度或者必应即可查到。我们首先从图机器学习中传统方法开始学习。图机器学习中传统方法在传统的图机器学习的方法中，针对节点、边、图都有一些基础的算法进行量化描述：因为只有将节点、边、图量化成数
2021-11-07 22:23:54
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原创 HoroPCA: Hyperbolic Dimensionality Reduction via Horospherical Projections 学习笔记——2.方法与代码
本文承接上一篇文章：HoroPCA: Hyperbolic Dimensionality Reduction via Horospherical Projections 学习笔记——1.背景介绍1. HOROPCA算法为了介绍HOROPCA的具体算法，我们首先介绍传统欧氏空间中的PCA算法。1）欧氏空间PCA给定一个数据集SSS与目标维度KKK，PCA会贪婪地寻找一系列主成分p1,…,pKp_{1}, \ldots, p_{K}p1,…,pK使得最大化正交投影πo,p1,…,pkE(⋅)\pi_
2021-10-31 23:12:02
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原创 HoroPCA: Hyperbolic Dimensionality Reduction via Horospherical Projections 学习笔记——1.背景介绍
HoroPCA学习笔记1. 背景介绍本篇博客学习的文章为：HoroPCA: Hyperbolic Dimensionality Reduction via Horospherical Projections。传统欧氏空间（Euclidean spaces）的主成分分析（Principal Component Analysis，PCA）是一种基本的降维技术，它寻找最能解释原始数据的一系列方向。下面将PCA推广到一般的双曲空间。给定一个方向，PCA依赖于下述几个核心点：这些方向所张成的仿射子空间（
2021-10-31 23:08:26
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原创 双曲嵌入论文与代码实现——2. 方法与代码
本篇接上一篇：双曲嵌入论文与代码实现——1. 数据集介绍1. 方法说明首先学习相关的论文中的一些知识，并结合进行代码的编写。文中主要使用Poincaré embedding。整体的空间为一个ddd维的开球：Bd={x∈Rd∣∥x∥<1}\mathcal{B}^{d}=\left\{\boldsymbol{x} \in \mathbb{R}^{d} \mid\|\boldsymbol{x}\|<1\right\}Bd={x∈Rd∣∥x∥<1}，∥⋅∥\|\cdot\|∥⋅∥为欧几里得范
2021-10-31 22:54:54
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原创 双曲嵌入论文与代码实现——1. 数据集介绍
双曲嵌入论文与代码实现由于双曲嵌入相关的文章已经有了一系列的代码。本篇博客主要目的实现最开始的双曲嵌入论文，将论文中有些直接写出来的内容进行了细节的推导，同时实现对应的代码。学习的文章：Poincaré Embeddings for Learning Hierarchical Representations主要参考的代码：poincare_embeddingsgensim – Topic Modelling in Python - poincare.py由于有些代码难以运行，有些比较难
2021-10-31 22:16:16
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原创 双曲嵌入深度学习
1. 双曲空间双曲空间的定义是曲率为负常数的一类空间。我们首先以一个图为例，来看欧式空间与双曲空间的区别。左图为欧式空间，我们从中间节点向外部移动，走一步所能达到的网格数量是323^232，两步是525^252，网络空间会随着半径多项式（平方）的关系进行增长。反观右侧的树结构空间，假设为二叉树，从中心点向外走的节点个数是呈指数增长的，因此这是一个呈指数增长的空间。假设右侧的树结构我们嵌入到欧式空间上，那么红色的节点到绿色的节点在树上的距离相距888个结点，但直接在平面上看两个节点非常近。一个好的嵌入
2021-08-27 21:43:32
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原创 YOLO V5 实操
一、环境配置所需资源本教程使用到的工具有：1.anaconda, pycharm2.cuda≥10.1, cudnn与cuda版本对应上3.pytorch≥1.7.0二、前期准备2.1 创建新环境并进入新环境YOLOv5要求Python≥3.6.0，接下来的代码和例子均以我们服务器上的配置为例：conda create -n test python=3.8 #选择自己的服务器名称conda activate test2.2 下载源代码git clone https://github
2021-07-19 22:14:18
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原创 数据率失真理论（RATE DISTORTION THEORY）
数据率失真理论（Rate distortion theory）或称信息率-失真理论（information rate-distortion theory）是信息论的主要分支，其的基本问题可以归结如下：对于一个给定的信源（source, input signal）分布与失真度量，在特定的码率下能达到的最小期望失真是多少；或者为了满足一定的失真限制，可允许的最大码率为何，DDD 定义为失真的符号。要完全避免失真几乎不可能。处理信号时必须允许有限度的失真﹐可减小所必需的信息率。1959年﹐Claude Shan
2021-07-19 21:50:37
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原创 ReduNet 代码解读【Numpy 版本】
最近学习了ReduNet里面代码的框架，作为一个经常使用R的童鞋来说受益匪浅。本篇博客主要来介绍一下里面的代码的结构。这里我们主要针对用Numpy库构建的网络结构与代码逻辑进行学习与分析。下面对一个Iris数据的demo进行分析。首先是通过parser进行传参，在使用下述命令运行代码时，可以将参数纳入到代码中。python3 iris.py --layers 4000 --eta 0.1 --eps 0.1iris.py文件中传参部分如下所示。参数包括layers（网络层数）, eta（超参数，
2021-07-19 21:45:16
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原创 ReduNet 中的一些原理 及 The Rate-Distortion Function
两种编码率总体空间的编码率(coding rate)：R(Z,ϵ)≐12logdet(I+dmϵ2ZZ⊤),R(\boldsymbol{Z}, \epsilon) \doteq \frac{1}{2} \log \operatorname{det}\left(\boldsymbol{I}+\frac{d}{m \epsilon^{2}} \boldsymbol{Z} \boldsymbol{Z}^{\top}\right),R(Z,ϵ)≐21logdet(I+mϵ2dZZ⊤),以及类内空间
2021-07-19 21:40:29
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原创 ReduNet: A White-box Deep Network from the Principle 学习
最近在学习马毅老师的 NeurIPS 2020 中稿文章 MCR2，当时引起很多的报告，并且也上了热搜。抱着看一看的态度，认真学习了几篇核心的文章，并进行理解。作为 ReduNet: A White-box Deep Network from the Principle 的前置文章之一的，Deep Networks from Optimizing Rate Reduction，首先对其进行了学习。文章考虑的问题是针对分类问题，如何能够使得分类更加准确。使用的方法考虑到了数据的压缩与表示，非常类似对比学
2021-07-19 21:33:44
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原创 降低核方法在大样本高维数据情形复杂度的一些方法
目前使用核方法很容易遇到的问题是，当遇到大规模机器学习上时。目前有一些论文的方法来降低核方法在大样本高维数据情形的计算复杂度与空间复杂度。这里进行一个简单的归纳总结。1. 运用Bochner’s theorem有一种做法是使用那些平移不变的Kernel（高斯与拉普拉斯核），运用Bochner’s theorem，将核函数估计进行简化，而后从计算出来的分布中进行采样，从而可以达到降维的目的（May A, Garakani A B, Lu Z, et al. Kernel Approximation Me
2021-07-19 21:18:36
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原创 服务器上个人账户配置GPU环境完整版（跑深度学习）
1. 下载系列安装包1）NVIDIA 驱动程序首先找到显卡对应的型号，在 NVIDIA 驱动程序下载 链接处进行服务器相匹配的对应版本下载，而后在服务器运行下述代码，按照引导即可进行安装，对应版本号需要进行替换（这里可能要root的权限）。sh NVIDIA-Linux-x86_64-***.**.run如果是学校中的服务器，通常工程师会在在服务器上帮忙安装了最基础的 NVIDIA 默认的显卡驱动，所以上一步可以忽略。2）CUDA在安装CUDA之前，我们需要先查找驱动对应的CUDA版本，注意，
2021-01-25 15:59:45
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原创 深度学习如何引入先验知识（临床医生的诊断经验）
深度学习的问题在使用传统的深度学习网络对病灶进行分割时，如，FCNN, U-Net, Dense U-Net等，网络均只考虑了本身图像上的信息，让网络本身通过大量的图像与label的对应关系，进行深度学习模型的训练。这一系列过程中没有任何人工的干预以及人为的先验信息。当数据量十分巨大时，这种做法往往能够取得非常好的分割效果，但当数据量相对较小时，如很多医学影像数据往往只有几十张精准标注的图像，引入医生本身的解剖学信息往往能够取得更好的分割效果。但问题的难点在于如何将医生的临床知识进行量化表示，并与深度学习
2021-01-11 22:20:44
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ggplot2_slides.zip
2020-08-03
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