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系统简述预处理阶段（preprocess)，将输入的tumor，normal，reference预处理整合成多个.tsv文件。预测阶段（call)，将输入的.tsv文件按照图中所示的resnet模型，输入进去。后处理阶段(postprocess)，将预测阶段数据格式：BAM文件BAM是SAM文件的二进制格式。SAM(Sequence Alignment/Map)格式是一种通用的比对...
2020-05-26 19:34:56
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原创 c++ 特性之 rtti 相关实现原理
c++ rtti 特性即 （running time type identification) 运行时鉴别对象类型的能力。主要功能分为 typeid 函数 以及 dynamic_cast函数。更深入的贡献就是实现了虚函数（c++的虚函数，就是针对指针所指向的内存空间的实际类型的重载函数）。虚函数的motivation是为了父类和子类可以用同名的函数但使用不同的实现方法。明显而又简单的实现方...
2020-04-07 21:31:05
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原创 CheXpert: A Large Chest Radiograph Dataset with Uncertainty Labels and Expert Comparison
核心贡献为较高质量标注的X-Ray图像数据集，由Andrew Y. Ng发布，中选AAAI2019。数据集包含224,316张X-Ray照片共属于65,240病人，对所选择的14种病症标注为positive，negative或者uncertain。组件含有一个用于将报告转化为对应14种病症是否可见的labeler，一个将输入的图片组转化为长度为14的元组，对应表示每种病症患病可能性。
2020-03-29 21:58:50
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原创 brief on NegBio,a rule-based nlp tool
NegBio: a high-performance tool for negation and uncertainty detection in radiology reports痛点引文中所称，传统nlp算法的痛点在于对较长的句子，就丧失对句子的分析能力了与该模型对比的方法是Negex，显然就文中提及，我们可以认为negex根据的是类似滑动窗口的方式。贡献提出了基于语法树，依赖...
2020-03-18 22:32:11
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空空如也
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