能够绘制基因簇结构图的工具有不少,例如在线工具 Gene Structure Dispaly Server(主要用于绘制基因结构图、基因簇结构图),或者本地工具SnapGene viewer(专业的质粒图谱绘制软件,也可绘制基因簇结构图)。今天小编再给大家提供一个曲线救国的方案:生成 svg 代码——图片调整。以下是基因簇结构图的示意图,可以根据需要添加标注或注释信息。
基因簇结构图
1工具
绘图所用的全部工具及软件都可以从该链接中获取:
https://pan.baidu.com/s/1sm8Qccl
2软件准备
(1)生成 svg 代码时基于 python 脚本,如果您的电脑中没有安装 python(3版本),可以通过上面提供的链接下载 python-3.6.4.exe 并进行安装;
(2)图片调整时使用 inkscape,如果您的电脑中没有该软件,请通过上面提供的链接下载 inkscape-0.92.2-x64.exe 并进行安装;
(3)inkscape 的运行依赖于 java 环境,如果您的电脑中未安装 java 或者版本较低导致inkscape运行报错,请通过上面提供的链接下载 JavaSetup8u151.exe 并进行安装或升级。
3准备数据
全部绘图工作开始于一个合格的数据集,要求格式如下,各列之间使用 tab 键分隔,或者直接从 excel 中粘贴到文本文件