matlab画动态聚类图,聚类热图,你用什么软件画?

本文介绍了如何使用Multiple Experiment Viewer (MeV) 软件绘制聚类热图,并进行动态分析。MeV提供了多种聚类方法,如分层聚类、k-means聚类等。通过实例展示了使用MeV进行基因和样本聚类的步骤,以及调整图像大小和选择不同距离计算方式对结果的影响。此外,还提到了MeV的其他功能,如SAM分析、生存分析、PCA和网络构建。
摘要由CSDN通过智能技术生成

原标题:聚类热图,你用什么软件画?

7f04ce87cb5a462c50fda75d96b8ada0.png

聚类热图是我们展示芯片、或者测序结果比较常用的方式,在文章中出现的频率非常高,一般来说,这张图的每行对应一个基因,每列对应一个样本,行和列形成的是基因数*样本数的表格,接下来用不同的颜色代表基因在样本中的表达量。颜色的设置有很多种,一般常见的是上图中的红绿搭配,还有蓝黄、彩虹色等等。

在前面的文章和两篇文章中,依凡和怪阿姨分别为我们介绍了如何使用R语言和网页版Heatmap Illustrator绘制聚类热图,下面我们再为大家介绍一个工具:MeV(Multiple ExperimentViewer)。

d5b22428caf272952da3f617eb704299.png

MeV的下载网址:https://sourceforge.net/projects/mev-tm4/files/mev-tm4/

我们用MeV的最新版本4.9.0来演示,用到的数据是依凡在用R语言绘制的时候用到的数据,数据和代码下载链接:http://pan.baidu.com/s/1eRKmzuE 密码:be2i

软件下载后直接打开Mev.exe软件:

  • 0
    点赞
  • 2
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值