原标题:聚类热图,你用什么软件画?
聚类热图是我们展示芯片、或者测序结果比较常用的方式,在文章中出现的频率非常高,一般来说,这张图的每行对应一个基因,每列对应一个样本,行和列形成的是基因数*样本数的表格,接下来用不同的颜色代表基因在样本中的表达量。颜色的设置有很多种,一般常见的是上图中的红绿搭配,还有蓝黄、彩虹色等等。
在前面的文章和两篇文章中,依凡和怪阿姨分别为我们介绍了如何使用R语言和网页版Heatmap Illustrator绘制聚类热图,下面我们再为大家介绍一个工具:MeV(Multiple ExperimentViewer)。
MeV的下载网址:https://sourceforge.net/projects/mev-tm4/files/mev-tm4/
我们用MeV的最新版本4.9.0来演示,用到的数据是依凡在用R语言绘制的时候用到的数据,数据和代码下载链接:http://pan.baidu.com/s/1eRKmzuE 密码:be2i
软件下载后直接打开Mev.exe软件: