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RSS订阅原创 QIIME 2 16S扩增子分析基础流程及常用命令（新手友好向）
整理了之前的QIIME 2 学习总结，挑选了非常基础实用的部分做一个QIIME 2 学习大礼包（没错就是这篇文章）。对基础分析的流程来说内容涵盖非常全。后续会添加部分拓展内容（比如图文解释等）。以下是正文内容：QIIME 2 官方论坛（非常有用哦）QIIME 2 官方文档：【中文参考】【英文原版】 https://docs.qiime2.org/2020.2/非常实用的参考教程：QIIME 2用户文档.4人体各部位微生物组分析实战MovingPictures微生物组1
2020-07-11 19:16:39
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原创 扩增子聚类之术语“ seed ”
前面的swarm聚类文章中讲到过，“ seed ” 是 de novo 思想的算法在聚类时，选择的第一个作为质心或起点的高丰度扩增子，它通常作为 cluster 的代表序列参与物种注释等其它分析。从计算机角度来看：算法的开始，创建一个初始为空的数据库，并在处理输入序列扩展数据库。对于每一个 cluster ， 数据库只精确地包含一个代表性序列。在UCLUST中，“ seed 序列 ” 这个术语不再使用，为了避免与 BLAST 和 UBLAST 等算法中的对齐种子（即：查询序列与参考序列比对上的匹配词
2020-07-11 15:17:10
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原创 nRF24L01无线通信模块使用简介（接收端）
nRF24L01无线通信模块使用简介（STC51）接收端书接上回，上篇博客给出了nRF24L01搭配C51单片机进行无线通信的发送端代码。这里给出接收端代码。接收端接收端的功能主要是接收发送端发来的数据，并将数据通过串口发送给上位机。发送端接收端正常通信后，在PC上使用常用的串口读取软件，就可以看到发送过来的数据了，串口的波特率设置在9600。与C51连线接收端nRF24L01模块与C51连线与发送端相同。下面还是废话少说直接给出代码#include <reg51.h>#in
2020-06-24 17:30:09
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原创 nRF24L01无线通信模块使用简介
nRF24L01无线通信模块使用简介（STC51）nRF24L01研一课设做过一个基于nRF24L01的无线温湿度传感器，在这里把C51单片机搭配nRF24L01的无线通信模块部分单独拿出来简单写一下，包含代码。nRF24L01nRF24L01是由NORDIC生产的工作在2.4GHz~2.5GHz的ISM 频段的单片无线收发器芯片。无线收发器包括：频率发生器、增强型“SchockBurst”模式控制器、功率放大器、晶体振荡器、调制器和解调器。（百度百科）nRF2401的芯片封装图如下，共24pin。
2020-06-23 10:46:11
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原创 16S 扩增子分析工具：Swarm 聚类OTU流程介绍
前段时间为了写资料而搜寻 swarm 相关内容无果，在谷歌学术翻到一篇 swarm 的学术论文（严格来说就是 swarm 的论文），在学习过程中主要对 swarm 的工作流程做了了解。想写一篇总结，但写着写着差点变成了文献翻译，不知道现在算不算解读。整理出的内容适合入行不久，想了解 de novo OTU聚类方法的情况（主要是swarm）（虽然现在OTU已经out，已经有了更好的 denoise 方法，但作为新人多学习还是没有坏处的），如果想引用这篇学术论文：Cite this asMahé F,
2020-06-18 15:29:24
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QIIME2扩增子分析流程及常用命令.pdf
2020-07-13
空空如也
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