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原创 必收藏!超详细的小鼠全基因组测序数据分析流程!
下载的vcf文件中header中的##reference=GCF_000001635.24,一定要存在该reference,就是说你用到的reference 文件名字一定要是header中的这个名字。我目前在构建一个能够互相分享系统深入学生信的社群(免费提供内部生信学习资料),且大家也可以通过创作获得收益,有认同我理念的小伙伴可以来找我聊聊哈!如果是人类样本,一般用GATK的bundle资源进行VQSR,但是小鼠的资源非常少,而且样本数少也不建议用VQSR,因此后面只能自己设置参数进行硬质控过滤了!
2023-10-27 22:02:40 850 2
原创 一文理解全外显子家系和病例-对照参考基因组比对和变异检测全流程
这篇文章是我的生信社群的部分内容,现在开个遗传学专栏,分享一些遗传学数据分析教程,更多教程可以加入我的生信社群查看。看完这篇文章,完全理解参考基因组比对和变异检测全流程!
2023-08-14 21:57:05 962
原创 install_github安装包报错说download falied的解决方案
install_github安装包报错说download falied的解决方案
2023-07-20 23:28:02 1678 3
原创 vscode远程连接不上服务器的R:提示不能找到“.vsc.attach“
vscode提示不能找到".vsc.attach", 也不能用ctrl+enter快捷键运行R 的解决方案
2023-07-20 22:22:57 616 2
原创 如何进行单基因病和复杂疾病的遗传学研究?
单基因遗传病,即孟德尔遗传疾病,是指受一对等位基因(主效基因)控制的遗传性疾病。孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。复杂疾病,是由多个基因及环境因素相互作用所致的疾病,例如心血管疾病、二型糖尿病、原发性高血压、银屑病等。对于这些疾病,有哪些实验设计,需要注意什么问题?这个教程写的非常详细了!值得收藏!
2023-07-20 19:00:24 541 1
空空如也
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