两台服务器制作集群

本文详细描述了如何在MachineA上安装GROMACS,并通过创建脚本在MachineB上执行任务,包括本地脚本编写、权限设置、使用SSH和rsync进行远程传输以及执行远程脚本的过程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

如果你要在 MachineA 上安装 GROMACS,并希望通过脚本在 MachineB 上调用 GROMACS 运行任务,你可以按照以下步骤进行:

在 MachineA 上安装 GROMACS:

根据 GROMACS 官方网站或使用包管理器(如 apt)安装 GROMACS。以下是 Ubuntu 上的示例:
bash
Copy code
sudo apt update
sudo apt install gromacs
创建脚本:

在 MachineA 上创建一个脚本,比如 run_gromacs.sh,内容如下:
bash
Copy code
#!/bin/bash

这里是 GROMACS 命令,可以根据需要修改

gmx=“gmx”

运行 GROMACS 命令

$gmx your_gromacs_command_here
赋予脚本执行权限:

在 MachineA 上执行以下命令:
bash
Copy code
chmod +x run_gromacs.sh
创建远程执行脚本:

在 MachineA 上创建一个新的脚本,比如 run_gromacs_remote.sh,内容如下:
bash
Copy code
#!/bin/bash

这里是你的远程机器的地址

remote_machine=“user@MachineB”

使用 ssh 和 rsync 将本地脚本传输到远程机器

rsync -avz -e ssh run_gromacs.sh $remote_machine:/tmp/

在远程机器上执行脚本

ssh $remote_machine “bash /tmp/run_gromacs.sh”
赋予远程执行脚本权限:

在 MachineA 上执行以下命令:
bash
Copy code
chmod +x run_gromacs_remote.sh
执行远程执行脚本:

运行 run_gromacs_remote.sh 脚本,它会将 run_gromacs.sh 传输到 MachineB 并在 MachineB 上执行 GROMACS 命令。
确保你在 run_gromacs.sh 中设置正确的 GROMACS 命令和参数,以及在 run_gromacs_remote.sh 中设置正确的远程机器地址。这样,你就可以在 MachineA 上维护 GROMACS 软件,而在 MachineB 上执行计算任务。

  • 5
    点赞
  • 10
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值