系统中出现大量不可中断进程和僵尸进程怎么办?(上)

一定要记得,当碰到无法解释的 CPU 使用率问题时,先要检查一下是不是短时应用在捣鬼。

短时应用的运行时间比较短,很难在 top 或者 ps 这类展示系统概要和进程快照的工具中发现,你需要使用记录事件的工具来配合诊断,比如 execsnoop 或者 perf top。

等待 I/O 的 CPU 使用率(以下简称为 iowait)升高,也是最常见的一个服务器性能问题。今天我们就来看一个多进程 I/O 的案例,并分析这种情况。

当 iowait 升高时,进程很可能因为得不到硬件的响应,而长时间处于不可中断状态。从 ps 或者 top 命令的输出中,你可以发现它们都处于 D 状态,也就是不可中断状态(Uninterruptible Sleep)。既然说到了进程的状态,进程有哪些状态你还记得吗?我们先来回顾一下。

top 和 ps 是最常用的查看进程状态的工具,我们就从 top 的输出开始。下面是一个 top 命令输出的示例,S 列(也就是 Status 列)表示进程的状态。从这个示例里,你可以看到 R、D、Z、S、I 等几个状态,它们分别是什么意思呢?

$ top
  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
28961 root      20   0   43816   3148   4040 R   3.2  0.0   0:00.01 top
  620 root      20   0   37280  33676    908 D   0.3  0.4   0:00.01 app
    1 root      20   0  160072   9416   6752 S   0.0  0.1   0:37.64 systemd
 1896 root      20   0       0      0      0 Z   0.0  0.0   0:00.00 devapp
    2 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   0:00.10 kthreadd
    4 root       0 -20       0      0      0 I   0.0  0.0   0:00.00 kworker/0:0H
    6 root       0 -20       0      0      0 I   0.0  0.0   0:00.00 mm_percpu_wq
    7 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   0:06.37 ksoftirqd/0

R 是 Running 或 Runnable 的缩写,表示进程在 CPU 的就绪队列中,正在运行或者正在等待运行。

D 是 Disk Sleep 的缩写,也就是不可中断状态睡眠(Uninterruptible Sleep),一般表示进程正在跟硬件交互,并且交互过程不允许被其他进程或中断打断。

Z 是 Zombie 的缩写,如果你玩过“植物大战僵尸”这款游戏,应该知道它的意思。它表示僵尸进程,也就是进程实际上已经结束了,但是父进程还没有回收它的资源(比如进程的描述符、PID 等)。

S 是 Interruptible Sleep 的缩写,也就是可中断状态睡眠,表示进程因为等待某个事件而被系统挂起。当进程等待的事件发生时,它会被唤醒并进入 R 状态。

I 是 Idle 的缩写,也就是空闲状态,用在不可中断睡眠的内核线程上。前面说了,硬件交互导致的不可中断进程用 D 表示,但对某些内核线程来说,它们有可能实际上并没有任何负载,用 Idle 正是为了区分这种情况。要注意,D 状态的进程会导致平均负载升高, I 状态的进程却不会。

当然了,上面的示例并没有包括进程的所有状态。除了以上 5 个状态,进程还包括下面这 2 个状态。第一个是 T 或者 t,也就是 Stopped 或 Traced 的缩写,表示进程处于暂停或者跟踪状态。

向一个进程发送 SIGSTOP 信号,它就会因响应这个信号变成暂停状态(Stopped);再向它发送 SIGCONT 信号,进程又会恢复运行(如果进程是终端里直接启动的,则需要你用 fg 命令,恢复到前台运行)。

而当你用调试器(如 gdb)调试一个进程时,在使用断点中断进程后,进程就会变成跟踪状态,这其实也是一种特殊的暂停状态,只不过你可以用调试器来跟踪并按需要控制进程的运行。

另一个是 X,也就是 Dead 的缩写,表示进程已经消亡,所以你不会在 top 或者 ps 命令中看到它。

了解了这些,我们再回到今天的主题。先看不可中断状态,这其实是为了保证进程数据与硬件状态一致,并且正常情况下,不可中断状态在很短时间内就会结束。所以,短时的不可中断状态进程,我们一般可以忽略。

但如果系统或硬件发生了故障,进程可能会在不可中断状态保持很久,甚至导致系统中出现大量不可中断进程。这时,你就得注意下,系统是不是出现了 I/O 等性能问题。

再看僵尸进程,这是多进程应用很容易碰到的问题。正常情况下,当一个进程创建了子进程后,它应该通过系统调用 wait() 或者 waitpid() 等待子进程结束,回收子进程的资源;而子进程在结束时,会向它的父进程发送 SIGCHLD 信号,所以,父进程还可以注册 SIGCHLD 信号的处理函数,异步回收资源。

如果父进程没这么做,或是子进程执行太快,父进程还没来得及处理子进程状态,子进程就已经提前退出,那这时的子进程就会变成僵尸进程。换句话说,父亲应该一直对儿子负责,善始善终,如果不作为或者跟不上,都会导致“问题少年”的出现。

通常,僵尸进程持续的时间都比较短,在父进程回收它的资源后就会消亡;或者在父进程退出后,由 init 进程回收后也会消亡。

一旦父进程没有处理子进程的终止,还一直保持运行状态,那么子进程就会一直处于僵尸状态。大量的僵尸进程会用尽 PID 进程号,导致新进程不能创建,所以这种情况一定要避免。

dstat 是一个新的性能工具,它吸收了 vmstat、iostat、ifstat 等几种工具的优点,可以同时观察系统的 CPU、磁盘 I/O、网络以及内存使用情况。

案例:

$ docker run --privileged --name=app -itd feisky/app:iowait

然后,输入 ps 命令,确认案例应用已正常启动。如果一切正常,你应该可以看到如下所示的输出:

$ ps aux | grep /app
root      4009  0.0  0.0   4376  1008 pts/0    Ss+  05:51   0:00 /app
root      4287  0.6  0.4  37280 33660 pts/0    D+   05:54   0:00 /app
root      4288  0.6  0.4  37280 33668 pts/0    D+   05:54   0:00 /app

从这个界面,我们可以发现多个 app 进程已经启动,并且它们的状态分别是 Ss+ 和 D+。其中,S 表示可中断睡眠状态,D 表示不可中断睡眠状态,我们在前面刚学过,那后面的 s 和 + 是什么意思呢?不知道也没关系,查一下 man ps 就可以。现在记住,s 表示这个进程是一个会话的领导进程,而 + 表示前台进程组。

这里又出现了两个新概念,进程组和会话。它们用来管理一组相互关联的进程,意思其实很好理解。进程组表示一组相互关联的进程,比如每个子进程都是父进程所在组的成员;而会话是指共享同一个控制终端的一个或多个进程组。

比如,我们通过 SSH 登录服务器,就会打开一个控制终端(TTY),这个控制终端就对应一个会话。而我们在终端中运行的命令以及它们的子进程,就构成了一个个的进程组,其中,在后台运行的命令,构成后台进程组;在前台运行的命令,构成前台进程组。

明白了这些,我们再用 top 看一下系统的资源使用情况:

# 按下数字 1 切换到所有 CPU 的使用情况,观察一会儿按 Ctrl+C 结束
$ top
top - 05:56:23 up 17 days, 16:45,  2 users,  load average: 2.00, 1.68, 1.39
Tasks: 247 total,   1 running,  79 sleeping,   0 stopped, 115 zombie
%Cpu0  :  0.0 us,  0.7 sy,  0.0 ni, 38.9 id, 60.5 wa,  0.0 hi,  0.0 si,  0.0 st
%Cpu1  :  0.0 us,  0.7 sy,  0.0 ni,  4.7 id, 94.6 wa,  0.0 hi,  0.0 si,  0.0 st
...

  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
 4340 root      20   0   44676   4048   3432 R   0.3  0.0   0:00.05 top
 4345 root      20   0   37280  33624    860 D   0.3  0.0   0:00.01 app
 4344 root      20   0   37280  33624    860 D   0.3  0.4   0:00.01 app
    1 root      20   0  160072   9416   6752 S   0.0  0.1   0:38.59 systemd
...

先看第一行的平均负载( Load Average),过去 1 分钟、5 分钟和 15 分钟内的平均负载在依次减小,说明平均负载正在升高;而 1 分钟内的平均负载已经达到系统的 CPU 个数,说明系统很可能已经有了性能瓶颈。

再看第二行的 Tasks,有 1 个正在运行的进程,但僵尸进程比较多,而且还在不停增加,说明有子进程在退出时没被清理。

接下来看两个 CPU 的使用率情况,用户 CPU 和系统 CPU 都不高,但 iowait 分别是 60.5% 和 94.6%,好像有点儿不正常。最后再看每个进程的情况, CPU 使用率最高的进程只有 0.3%,看起来并不高;但有两个进程处于 D 状态,它们可能在等待 I/O,但光凭这里并不能确定是它们导致了 iowait 升高。

我们在终端中运行 dstat 命令,观察 CPU 和 I/O 的使用情况:

# 间隔1秒输出10组数据
$ dstat 1 10
You did not select any stats, using -cdngy by default.
--total-cpu-usage-- -dsk/total- -net/total- ---paging-- ---system--
usr sys idl wai stl| read  writ| recv  send|  in   out | int   csw
  0   0  96   4   0|1219k  408k|   0     0 |   0     0 |  42   885
  0   0   2  98   0|  34M    0 | 198B  790B|   0     0 |  42   138
  0   0   0 100   0|  34M    0 |  66B  342B|   0     0 |  42   135
  0   0  84  16   0|5633k    0 |  66B  342B|   0     0 |  52   177
  0   3  39  58   0|  22M    0 |  66B  342B|   0     0 |  43   144
  0   0   0 100   0|  34M    0 | 200B  450B|   0     0 |  46   147
  0   0   2  98   0|  34M    0 |  66B  342B|   0     0 |  45   134
  0   0   0 100   0|  34M    0 |  66B  342B|   0     0 |  39   131
  0   0  83  17   0|5633k    0 |  66B  342B|   0     0 |  46   168
  0   3  39  59   0|  22M    0 |  66B  342B|   0     0 |  37   134

从 dstat 的输出,我们可以看到,每当 iowait 升高(wai)时,磁盘的读请求(read)都会很大。这说明 iowait 的升高跟磁盘的读请求有关,很可能就是磁盘读导致的。

我们继续在刚才的终端中,运行 top 命令,观察 D 状态的进程:

# 观察一会儿按 Ctrl+C 结束
$ top
...
  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
 4340 root      20   0   44676   4048   3432 R   0.3  0.0   0:00.05 top
 4345 root      20   0   37280  33624    860 D   0.3  0.0   0:00.01 app
 4344 root      20   0   37280  33624    860 D   0.3  0.4   0:00.01 app
...

我们从 top 的输出找到 D 状态进程的 PID,你可以发现,这个界面里有两个 D 状态的进程,PID 分别是 4344 和 4345。接着,我们查看这些进程的磁盘读写情况。对了,别忘了工具是什么。一般要查看某一个进程的资源使用情况,都可以用我们的老朋友 pidstat,不过这次记得加上 -d 参数,以便输出 I/O 使用情况。

# -d 展示 I/O 统计数据,-p 指定进程号,间隔 1 秒输出 3 组数据
$ pidstat -d -p 4344 1 3
06:38:50      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:38:51        0      4344      0.00      0.00      0.00       0  app
06:38:52        0      4344      0.00      0.00      0.00       0  app
06:38:53        0      4344      0.00      0.00      0.00       0  app

在这个输出中, kB_rd 表示每秒读的 KB 数, kB_wr 表示每秒写的 KB 数,iodelay 表示 I/O 的延迟(单位是时钟周期)。它们都是 0,那就表示此时没有任何的读写,说明问题不是 4344 进程导致的。可是,用同样的方法分析进程 4345,你会发现,它也没有任何磁盘读写。

在终端中运行下面的 pidstat 命令:

# 间隔 1 秒输出多组数据 (这里是 20 组)
$ pidstat -d 1 20
...
06:48:46      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:47        0      4615      0.00      0.00      0.00       1  kworker/u4:1
06:48:47        0      6080  32768.00      0.00      0.00     170  app
06:48:47        0      6081  32768.00      0.00      0.00     184  app

06:48:47      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:48        0      6080      0.00      0.00      0.00     110  app

06:48:48      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:49        0      6081      0.00      0.00      0.00     191  app

06:48:49      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command

06:48:50      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:51        0      6082  32768.00      0.00      0.00       0  app
06:48:51        0      6083  32768.00      0.00      0.00       0  app

06:48:51      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:52        0      6082  32768.00      0.00      0.00     184  app
06:48:52        0      6083  32768.00      0.00      0.00     175  app

06:48:52      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command
06:48:53        0      6083      0.00      0.00      0.00     105  app
...

观察一会儿可以发现,的确是 app 进程在进行磁盘读,并且每秒读的数据有 32 MB,看来就是 app 的问题。不过,app 进程到底在执行啥 I/O 操作呢?

这里,我们需要回顾一下进程用户态和内核态的区别。进程想要访问磁盘,就必须使用系统调用,所以接下来,重点就是找出 app 进程的系统调用了。

strace 正是最常用的跟踪进程系统调用的工具。所以,我们从 pidstat 的输出中拿到进程的 PID 号,比如 6082,然后在终端中运行 strace 命令,并用 -p 参数指定 PID 号:

$ strace -p 6082
strace: attach: ptrace(PTRACE_SEIZE, 6082): Operation not permitted

这儿出现了一个奇怪的错误,strace 命令居然失败了,并且命令报出的错误是没有权限。按理来说,我们所有操作都已经是以 root 用户运行了,为什么还会没有权限呢?你也可以先想一下,碰到这种情况,你会怎么处理呢?

一般遇到这种问题时,我会先检查一下进程的状态是否正常。比如,继续在终端中运行 ps 命令,并使用 grep 找出刚才的 6082 号进程:

$ ps aux | grep 6082
root      6082  0.0  0.0      0     0 pts/0    Z+   13:43   0:00 [app] <defunct>

果然,进程 6082 已经变成了 Z 状态,也就是僵尸进程。僵尸进程都是已经退出的进程,所以就没法儿继续分析它的系统调用。关于僵尸进程的处理方法,我们一会儿再说,现在还是继续分析 iowait 的问题。

你可以用 perf top 看看有没有新发现。再或者,可以像我一样,在终端中运行 perf record,持续一会儿(例如 15 秒),然后按 Ctrl+C 退出,再运行 perf report 查看报告:

我们来看其他信息,你可以发现, app 的确在通过系统调用 sys_read() 读取数据。并且从 new_sync_read 和 blkdev_direct_IO 能看出,进程正在对磁盘进行直接读,也就是绕过了系统缓存,每个读请求都会从磁盘直接读,这就可以解释我们观察到的 iowait 升高了。

下面的问题就容易解决了。我们接下来应该从代码层面分析,究竟是哪里出现了直接读请求。查看源码文件 app.c,你会发现它果然使用了 O_DIRECT 选项打开磁盘,于是绕过了系统缓存,直接对磁盘进行读写。

接下来,我们就来处理僵尸进程的问题。既然僵尸进程是因为父进程没有回收子进程的资源而出现的,那么,要解决掉它们,就要找到它们的根儿,也就是找出父进程,然后在父进程里解决。

# -a 表示输出命令行选项
# p表PID
# s表示指定进程的父进程
$ pstree -aps 3084
systemd,1
  └─dockerd,15006 -H fd://
      └─docker-containe,15024 --config /var/run/docker/containerd/containerd.toml
          └─docker-containe,3991 -namespace moby -workdir...
              └─app,4009
                  └─(app,3084)

虽然这个案例是磁盘 I/O 导致了 iowait 升高,不过, iowait 高不一定代表 I/O 有性能瓶颈。当系统中只有 I/O 类型的进程在运行时,iowait 也会很高,但实际上,磁盘的读写远没有达到性能瓶颈的程度。因此,碰到 iowait 升高时,需要先用 dstat、pidstat 等工具,确认是不是磁盘 I/O 的问题,然后再找是哪些进程导致了 I/O。等待 I/O 的进程一般是不可中断状态,所以用 ps 命令找到的 D 状态(即不可中断状态)的进程,多为可疑进程。但这个案例中,在 I/O 操作后,进程又变成了僵尸进程,所以不能用 strace 直接分析这个进程的系统调用。这种情况下,我们用了 perf 工具,来分析系统的 CPU 时钟事件,最终发现是直接 I/O 导致的问题。这时,再检查源码中对应位置的问题,就很轻松了。而僵尸进程的问题相对容易排查,使用 pstree 找出父进程后,去查看父进程的代码,检查 wait() / waitpid() 的调用,或是 SIGCHLD 信号处理函数的注册就行了。

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