WSL2+Ubuntu18.04.6+FSL/AFNI,普通用户的PATH配置
2024.3.19
~/.bashrc
~/.profile
~/.bash_profile
问题:
启动终端直接输入fsl或afni, command not found
踩坑:
根据 ①FSL/AFNI安装时自动设置的环境变量 或 ②GPT的建议
对 ~/.bashrc 或 ~/.profile文件进行了修改保存均没有作用
解决:
最终发现在~/.bash_profile文件中加入以下内容保存后重启终端可以直接输入fsl/afni并进行使用(同时删除了 ~/.bashrc 或 ~/.profile文件中关于fsl和afni的内容):
# FSL Setup
FSLDIR=/安装fsl的路径/fsl
PATH=${FSLDIR}/share/fsl/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
# auto-inserted by @update.afni.binaries :
export PATH=$PATH:/安装afni的路径/abin
# auto-inserted by @update.afni.binaries :
# set up tab completion for AFNI programs
if [ -f $HOME/.afni/help/all_progs.COMP.bash ]
then
source $HOME/.afni/help/all_progs.COMP.bash
fi