计算机在化学分子绘图中的应用
第一章 计算机在化学分子绘图中的应用
1.1 简介
Microsoft Office Word是一款非常强大的图文编辑软件,但没有提供绘制化学分子结构式
的工具。 现在微机上经常使用的绘制 2D 分子结构的软件为 ChemWindow、C S ChemDraw、I SIS
Draw 和 ChemSketch 等;绘制 3D 分子结构的软件有 CS Chem3D、HyperChem、WebLab
ViewerPro、ArgusLab 和 RasMol 等。2D 分子结构绘图软件的使用方法是基本相似的,我们将
选用 ChemWindow 6.0 为例介绍这类软件的基本用法。
ChemWindow () 常见的有3.0、5.0 、6.0 三个版本,3.0 版用于Windows
3.0, 其他两个版本均可以在 Windows 2000/Windows XP 下运行,6.0 版的安装文件约为 15MB。
安装时要求 Windows 已安装打印机驱动程序 (只安装驱动程序即可,不必非得有打印机) ,安
装步骤与一般 Windows 程序类似, 安装后即可运行。 程序打开后, 窗口界面与一般 Windows XP
的软件相似,依次包括菜单栏、工具栏和文档区 (图1.1) 。工具栏提供了许多常用的化学分子
及化学键,使用时单击一下工具栏中所需的工具,移动鼠标到编辑区后,指针变为“+” ,在
合适位置单击,则分子结构式就会出现,使用非常方便。ChemWindow 6.0 还支持 Windows
剪贴板,所有结构式可以方便地以对象形式剪贴到 Word文档中,而当要进行修改时,只需在
Word 文档中双击结构式, 即可打开 ChemWindow进行修改。 下面就从工具栏开始按功能分类
介绍 ChemWindow 6.0 软件的使用方法和技巧。
图 1.1 ChemWindow 6.0 界面
2 计算机在化学化工及生物工程中的应用
1.2 工具栏
ChemWindow 6.0 更改了工具栏的形式,使其与 Windows 的风格统一,同时提供了更多
的工具按钮以及增加了工具栏选择的自由度。View 菜单中可以设置显示哪些工具栏,用户可
以根据自己的需要显示或掩藏工具栏。单击带有右红三角的工具按钮,可以打开选择工具栏,
选择某工具后则显示该工具的按钮( 按钮不变,从这里可以选定模板) 。
在工作区右击,可以直接打开工具栏,如图 1.2 所示。
图 1.2 工具栏
(1)常用工具栏(Standard Tools) :提供了选择、套索、化学标记、键、环、模板以及
可选择工具按钮。
(2)自定义工具栏(Custom Palette) :提供可选择工具按钮。
(3)命令工具栏(Commands) :提供保存、打印、编辑及一些图形关系操作按钮。
(4)键工具栏(BondTools) :提供化学键按钮。
(5)图形工具栏(Graphic Tools) :提供文字、表格、箭头和自由绘图工具等按钮。
(6)轨道工具栏(Orbital Tools) :提供各种轨道图形按钮。
(7)其他工具栏(Other Tools) :提供板擦、环、长链等工具按钮。
第一章 计算机在化学分子绘图中的应用 3
(8)反应工具栏(Reaction Tools) :提供反应箭头工具按钮。
(9)符号工具栏(Symbol Tools) :提供电荷、自由基和其他符号标记按钮。
(10)模板工具栏(Templete Tools) :提供一些模板按钮。
(11)格式工具条 (Style Bar) :提供分子结构样式、字体、字号、颜色以及其他格式按钮。
(12)图形格式工具条(Graphics Style Bar) :提供图形样式按钮。
(13)缩放工具条(Zoom Bar) :提供缩放工具按钮。