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计算机在化学分子绘图中的应用

第一章 计算机在化学分子绘图中的应用

1.1  简介

Microsoft Office Word是一款非常强大的图文编辑软件，但没有提供绘制化学分子结构式

的工具。 现在微机上经常使用的绘制 2D 分子结构的软件为 ChemWindow、C S ChemDraw、I SIS

Draw  和  ChemSketch  等；绘制  3D  分子结构的软件有  CS  Chem3D、HyperChem、WebLab

ViewerPro、ArgusLab 和 RasMol 等。2D 分子结构绘图软件的使用方法是基本相似的，我们将

选用 ChemWindow 6.0 为例介绍这类软件的基本用法。

ChemWindow () 常见的有3.0、5.0  、6.0  三个版本，3.0  版用于Windows

3.0， 其他两个版本均可以在 Windows 2000/Windows XP 下运行，6.0  版的安装文件约为 15MB。

安装时要求 Windows 已安装打印机驱动程序 (只安装驱动程序即可，不必非得有打印机) ，安

装步骤与一般 Windows 程序类似， 安装后即可运行。 程序打开后， 窗口界面与一般 Windows XP

的软件相似，依次包括菜单栏、工具栏和文档区 (图1.1) 。工具栏提供了许多常用的化学分子

及化学键，使用时单击一下工具栏中所需的工具，移动鼠标到编辑区后，指针变为“+” ，在

合适位置单击，则分子结构式就会出现，使用非常方便。ChemWindow  6.0 还支持  Windows

剪贴板，所有结构式可以方便地以对象形式剪贴到 Word文档中，而当要进行修改时，只需在

Word 文档中双击结构式， 即可打开 ChemWindow进行修改。 下面就从工具栏开始按功能分类

介绍 ChemWindow 6.0  软件的使用方法和技巧。

图 1.1  ChemWindow 6.0 界面

2  计算机在化学化工及生物工程中的应用

1.2  工具栏

ChemWindow  6.0 更改了工具栏的形式，使其与 Windows 的风格统一，同时提供了更多

的工具按钮以及增加了工具栏选择的自由度。View 菜单中可以设置显示哪些工具栏，用户可

以根据自己的需要显示或掩藏工具栏。单击带有右红三角的工具按钮，可以打开选择工具栏，

选择某工具后则显示该工具的按钮( 按钮不变，从这里可以选定模板) 。

在工作区右击，可以直接打开工具栏，如图 1.2 所示。

图 1.2  工具栏

(1)常用工具栏(Standard  Tools) ：提供了选择、套索、化学标记、键、环、模板以及

可选择工具按钮。

(2)自定义工具栏(Custom Palette) ：提供可选择工具按钮。

(3)命令工具栏(Commands) ：提供保存、打印、编辑及一些图形关系操作按钮。

(4)键工具栏(BondTools) ：提供化学键按钮。

(5)图形工具栏(Graphic Tools) ：提供文字、表格、箭头和自由绘图工具等按钮。

(6)轨道工具栏(Orbital Tools) ：提供各种轨道图形按钮。

(7)其他工具栏(Other Tools) ：提供板擦、环、长链等工具按钮。

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(8)反应工具栏(Reaction Tools) ：提供反应箭头工具按钮。

(9)符号工具栏(Symbol Tools) ：提供电荷、自由基和其他符号标记按钮。

(10)模板工具栏(Templete Tools) ：提供一些模板按钮。

(11)格式工具条 (Style Bar) ：提供分子结构样式、字体、字号、颜色以及其他格式按钮。

(12)图形格式工具条(Graphics Style Bar) ：提供图形样式按钮。

(13)缩放工具条(Zoom Bar) ：提供缩放工具按钮。