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SIESTA-2.0安装

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SIESTA是采用数值原子轨道基矢展开晶体的波函数，离子实与价电子之间的相互作用采用模守恒赝势来描述的，其突出之处实现了O(N)算法，可以用来进行大规模数值计算，比如模拟蛋白质分子等复杂结构材料体系。目前已开发至2.0版本。要获取该程序，先从http://www.uam.es/departamentos/ciencias/fismateriac/siesta/下载license文件，打印后填写上你的个人信息，签名后，把该license通过航空信邮寄至license上写的地址，大概一周后，就会收到开发组告诉你下载SIESTA-2.0的帐号和密码。

下载，解压后，会有一下几个目录和文件：

Docs/ Examples/ Pseudo/ README SIESTA_LICENCE Src/ Tests/ Tutorials/ Util/ version.info

进入Src目录，在它的子目录Confs下，选择合适的configure文件(以.conf结尾的)。它提供了针对pgf90, g95和ifc编译的configure文件。这里以g95的为例：

将Confs子目录下的g95-cdf.conf拷贝至Src目录下arch.make

下面就可以键入make进行编译了。

(这里以假定安装好了g95编译器,以及把libnetcdf.a安装到了/usr/local/netcdf-g95/lib/目录中).

在Redhat上编译Siesta 1.3的步骤

作者：elizerbeth    文章来源：Yepriyo@zixia    点击数：524    更新时间：2005-12-8

平台：Redhat Advanced Server 3.0

Intel Xeon 2 CPU

编译器:pgi 5.1 Linux 86

具体步骤如下：

解压 siesta1.3.tar.tgz

然后到Src/Sys目录下，运行cp pgf90.make ../arch.make

此时应当注意arch.make 理由这样一句话：

# Important (at least for V5.0-1 of the pgf90 compiler...)

# Compile atom.f without optimization.

我的理解是对pgf90 v5.01 编译atom.f应without optimization,

在此编译器为V5.1 ,因此，将

#

atom.o:

$(FC) -c $(FFLAGS_DEBUG) atom.f

改为

#

atom.o:

$(FC) -c $(FFLAGS) atom.f

按照pgf90地说明FFLAGS是对应的with optomization,

保存arch.make退出，然后运行 make 即编译siesta不报错。

此行语句如果不修改的话，编译仍将报错。

接着在Pseudo/atom 目录下运行make编译Pseudo。

为了验证siesta编译成功，按照manual在siesta/test下建立test.fdf atom.psf 文件，其中atom.psf是要考察原子的Pseudo文件， 运行 ../siesta < test.fdf |tee test.out,如果siesta成功编译的话，即会输出相应的计算可结果，