siesta在Linux运行,Installation of NetCDF(Linux下siesta集成NetCDF)

Installation of NetCDF with CDF4 support (also installation of HDF5 and zlib)

安装目录下需要有以下文件

# zlib-1.2.8

# hdf5-1.8.16

# netcdf-4.4.0

# netcdf-fortran-4.4.3

# install.sh

$ bash ./install.sh

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# Completed installation #

# of NetCDF package #

# and its dependencies #

##########################

安装成功！

将下列提示加入到siesta的arch.make中

INCFLAGS += -I$ID/netcdf/${nc_v}/include

LDFLAGS += -L$ID/zlib/${z_v}/$zlib_lib -Wl,-rpath=$ID/zlib/${z_v}/$zlib_lib

LDFLAGS += -L$ID/hdf5/${h_v}/$hdf5_lib -Wl,-rpath=$ID/hdf5/${h_v}/$hdf5_lib LDFLAGS += -L$ID/netcdf/${nc_v}/$cdf_lib -Wl,-rpath=$ID/netcdf/${nc_v}/$cdf_lib

LIBS += -lnetcdff -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz

COMP_LIBS += libncdf.a libfdict.a

FPPFLAGS += -DCDF -DNCDF -DNCDF_4

此时再进行编译siesta、transiesta、TBtrans，生成的可执行程序便有了NETCDF4-support，如此就可以计算出电流以及nc文件。