每天一篇小文章---交互式小样本学习:有限的监督,更好的医疗图像分割

原文:Interactive Few-shot Learning: Limited Supervision, Better Medical Image Segmentation

作者:Ruiwei Feng*, Xiangshang Zheng*, Tianxiang Gao*, Jintai Chen, Wenzhe Wang, Student Member, IEEE, Danny Z. Chen, Fellow, IEEE, and Jian Wu B, Member, IEEE

背景:

        目前的医疗图像分割主要存在以下两个主要的问题:1、训练通常采用全监督的模式,需要大量的数据集和费时的标记,2、在某些特定的稀少疾病中,难以获得大量数据。

        采用传统的few-shot算法的问题在于:模型通过多个任务训练,积累了多个任务的共同特征,但是无法处理某一任务的独特特性,尤其是在医疗图像中更加明显;

解决的总体思路:

        在数量有限的样本中加强获取共同特征的能力:提出 Medical Prior-based Few-shot Learning Network (MPrNet)

        加强在有限标记的目标样本中获取特性的能力:把交互学习(Interactive Learning)引入到few-shot 任务中,提出 Interactive Learning-based Test Time Optimization Algorithm (IL-TTOA)

那么具体如何实现呢?


Q: MPrNet 网络如何提高获取共同特征能力?

网络结构:如下图所示,网络由ENCODE 和 DECODE两部分组成,其中ENCODE分为两条分支:空间分支Spatial branch,主要用于抓取图像的空间特征,如组织的位置信息,由四个5×5的卷积层组成,较大的卷积核能够(接受场,receptive fields)增加对全局空间特征的重视,而小量级的结构能够减少计算权重的困难)和纹理分支texture branch,提取图像细节纹理特征,由四个重复的卷积块构成,每个卷积块由两个3*3的卷积核,一个RELU和一个maxpool层组成,模仿VGG),其中Query set 和 Support set共享纹理分支权重,而空间分支的特征通过“通道挤压和空间激励”(Channel Squeeze & Spatial Excitation,sSE)加入到Query分支中。

 

信息交互与连接: 1、空间支路与查询支路的连接,有利于空间位置和纹理特征的结合;2、查询支路与纹理支路的连接:共享参数;3、“通道挤压和空间激励”(Channel Squeeze & Spatial Excitation,sSE):特征合并;

相似性函数融合:对于query set 的每一个样本,需要在support set里面寻找对于的特征,这类似于孪生网络,根据相似度,作为考虑query所提取的所有特征的注意权重;

专家交互修正机制:Interactive Learning-based Test Time Optimization Algorithm,在目标任务中取部分数据作为交互数据集,对于预测的结果进行专家手动修正:校正为正确的像素设置为1,校正为错误的像素设置为−1。其余未校正的像素设置为0。把矫正之后的蒙版和训练结果进行叠加,就能得到准确的LOSS值。但是文章中提到,不仅要考虑专家的意见,还要考虑训练过程中学习到的共性,故把LOSS函数设置如下:

         其中,前半部分来自于专家的修正,后半部分来自于训练过程中所学习到的重要性:Memory Aware Synapses (MAS),表达式如下:

         其中,gi,j(xpi)为梯度更新前后的网络参数θi和θj在相同的像素输入xpi得到的输出值;

实验结果表明:利用MPrNet网络框架比之前的sSENet和PANet具有更高的精确的,而且增加IL-TTOA这种专家交互矫正机制后,正确率能够普遍提高10%左右;


 

相关工作:针对医学图像样本少和标记困难问题的研究,写的蛮好的!

1、样本获取困难问题:

解决方案:few-shot learnning、数据增强

[20] S. Kadam and V . V aidya, “Review and analysis of zero, one and few shot learning approaches,” in International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, pp. 100–112, Springer, 2018.
[21] Y . Wang, Q. Yao, J. T. Kwok, and L. M. Ni, “Generalizing from a few examples: A survey on few-shot learning,” ACM Computing Surveys(CSUR), vol. 53, no. 3, pp. 1–34, 2020.

2、数据标记困难问题:

解决方案:主动学习(active learning,挑选部分更有价值的样本以更加高效率的方式进行标注)、交互学习(interactive learning,通过专家交互地改正训练预测值)

3、平衡数据集(标记量和数据量)和训练效果之间的矛盾问题

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