r包调用legend函数_使用R语言绘制热图：R包pheatmap的全参数详细介绍

pheatmap参数：

网上有针对热图绘制的粗略讲解，但是都是参数不完整，可能不能满足所有人需求，于是手动整理了热图的全参数介绍。

mat

数组矩阵(要绘制热图的数据源，保证数据是numeric类型)

color

热图的颜色选择

默认：colorRampPalette(rev(brewer.pal(n = 7, name ="RdYlBu")))(100)

break

用来定义数值和颜色的对应关系。可以将特定颜色和特定数值关联，如果NA则自动进行计算。如果颜色超过值的范围，超过阈值的会使用和阈值一样的颜色。

默认：NA

border_color

热图的单位元素的描边颜色，NA表示不描边

默认：“gray60”

cellwidth

热图单位元素(cell)的宽度，NA表示依据窗口自动调整

默认：NA

cellheight同

scale

数值标准(scale)化，可以是“row“,”column“,”none“

默认：“none”

cluster_rows

用布尔值来判定行元素是不是应该被clustered or clust object。

默认：TRUE

同理，cluster_cols决定是否应该把列clust

clustering_distance_rows

计算类间距的方式，

默认：“euclidean”(欧式距离)

clus