我正在努力编写一段代码,帮助我进行生物学工作。
代码的概念是分析在组织中收缩细胞的视频文件
Example 1
示例2:youtube.com/watch?v=uG_WOdGw6Rk
并绘出以下内容:
每分钟跳动次数
击败力量
跳动的规律
所以我写了一个Matlab代码,它可以循环播放一段视频,并比较每一帧和随后的帧,然后查看帧中是否有任何变化,并将这些变化绘制在曲线上。
我的代码结果示例
当前代码的核心我写道:
for i=2:totalframes
compared=read(vidObj,i);
ref=rgb2gray(compared);%% convert to gray
level=graythresh(ref);%% calculate threshold
compared=im2bw(compared,level);%% convert to binary
differ=sum(sum(imabsdiff(vid,compared))); %% get sum of difference between 2 frames
if (differ ~=0) && (any(amp==differ)==0) %%0 is = no change happened so i dont wana record that !
amp(end+1)=differ; % save difference to array amp wi
time(end+1)=i/framerate; %save to time array with sec's, used another array so i can filter both later.
vid=compared; %% save current frame as refrence to compare the next frame against.
end
end
figure,plot(amp,time);=====================
这就是我的代码,但有没有办法改进它,这样我可以得到更好的结果?
因为我担心imabsdiff并不完全是我应该使用的,因为我的视频包含很多噪音,并且会影响我的结果,而且我认为我所有的放大器数据实际上都是假的!
另外,我实际上只能通过计算峰值来提取跳动率,但是如何提高我的代码以便能够获取所有必需的数据?
也非常感谢你的帮助,这是代码的一小部分,如果你需要更多的信息,请让我知道。
谢谢