matlab进化树的下载,mega(进化树构建软件)下载 v7.0.14免费版

mega进化树软件是专为专业的生物或者科研人员打造的进化分析和分子鉴定软件,软件界面直观,功能强大,载入后就可以进行分子的分析操作了,有需要的快快下载吧。

使用教程

如何用MEGA7.0转化为MEGA7.0可以用的格式

物信息学实验有时候会要求做一些进化树图,但是我们所得到的序列一般都是FASTA格式,如何将FASTA格式转化成MEGA可以使用的格式呢。

1、打开MEGA7.0软件,熟悉MEGA7.0的版面

2、看到左上角的【Align】点击选择【Edit/Build Alignment】接下来会出现一个小窗口,点击【OK】

3、点击完【OK】又会弹出另一个小窗口,需要选择protein 或者DNA,看自己需要,这里演示先选择protein点击之后出现窗口,之后操作在新窗口中进行。

4、按图中箭头指示点击【Edit】再选择【Insert Sequence From File Ctrl+I】点击之后在文件夹中选择自己要改变的FASTA格式序列,选定之后打开。

5、打开序列我们会看到如下的小窗口,接下来在左上角选择【Date】在子菜单中选择【Export Alignment】【MEGA Format】

6、对刚才打开的文件命名,选择存储位置,命名好之后点击【保存】出现一个小窗口输入和刚才一样的名字进去,点击【OK】就好了,文件格式已转换成功。

MEGA 构建进化树方法

新建一个TXT格式的文档

打开文档,把需要构建分子进化树的基因序列的FASTA格式序列复制粘贴到TXT文档中,并保存。

将文本文档的后缀“TXT”更改为“fasta”,如下图所示。

双击fasta文件,由MEGA5.0打开,如图

单击W图标中的“Align DNA”,会提醒你选择序列,单击确定即可,如下图

比对后的序列如下图。

然后我们需要把“*”号之外的序列全部删除,只留下”*”标注的序列,保存一下

关闭小窗口,回到MEGA5.0的主界面,单击“phylogeny”的下拉符合,选择“Construct/Test Neighbor-Joining Tree…“,选择刚才保存的文档。

打开之后按照默认参数点击确定即可运行,最后得到进化树如图所示。

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