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原创 浅谈GWAS分析后的富集分析操作(GO/KEGG)
浅谈GWAS分析后的富集分析操作(GO/KEGG)作者:刘济铭########################在我们完成全基因组关联分析后,常常筛选得到特定性状的基因集,接下来,通常我们需要开展富集分析,筛选显著的基因功能富集和Pathway,这就要用到GO富集和KEGG富集。理论和结果解释同样在知乎和各平台有很多讲解,因此,我还是重点提供一个富集分析的R脚本,供大家交流学习。###GO富集分析R脚本#加载OrgDB包,OrgDB目前只有少数模式物种有公共数据库,通常大家研究的物种均已经建立了
2022-04-23 14:06:35
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原创 GEMMA 全基因组关联分析+CMplot多性状曼哈顿+QQ图脚本
这里写自定义目录标题GEMMA 全基因组关联分析+CMplot多性状曼哈顿+QQ图脚本GEMMA 全基因组关联分析+CMplot多性状曼哈顿+QQ图脚本###GEMMA 全基因组关联分析+CMplot多性状曼哈顿+QQ图脚本#作者:刘济铭##########################GWAS理论和基本结果理解已经有很多大神进行了解读,因此不再赘述,想要学习请移步知乎或各大基因课平台学习。本人发现目前缺乏具体实用脚本,因此本帖只提供本人脚本供大家交流学习,本人脚本不是最好肯定也会存在问题,请大
2022-04-23 12:10:25
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原创 SDMtoolbox 2.0 基于MaxEnt的快捷指令ArcGIS工具包简介
SDMtoolbox 2.0 基于MaxEnt的快捷指令ArcGIS工具包简介开门见山,大家既然可以关注到 SDMtoolbox 的应用,想必应该已经对生态位模型这一方面的理论有所了解,因此本文不再赘余,只讲干货,不懂或有问题的地方,请大家留言探讨,共同进步。SDMtoolbox 是基于ArcGIS系统的加载功能包,其算法和原理均来源于Phillips发表的生态位模型:最大信息熵模型(MaxEnt)。即利用物种空间分布数据的气候、地形、土壤等生态因子与研究区域的非随机关系,在满足一定限制条件的情况下,找
2020-07-16 18:17:36
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SDMtoolbox_2_10_4to6.zip
2020-07-16
世界各国高清地图+世界高清行政区划图+中国超清行政区划图+高清中国南方各省县级区划图.zip
2020-02-19
GloElev_5min.zip
2020-02-15
worldclimte 全球70-00年生物气象数据.zip
2020-01-30
中国1-5级河流,全国水系矢量图,行政区界(包含国界,省界,县界),主要交通道路(公路、铁路),居民地分布.zip
2020-01-30
空空如也
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