批量copy_【生信小课堂】批量化移动特定文件至特定文件夹

咕咕咕很久的一位靓仔的习惯性吐槽：前几天，某位老铁从深圳出差回来，然后跟我说能不能帮他写个脚本移动一下照片，然后我就欣然答应，因为这是我很久前想做的事情了，在我们日常的批量化处理序列文件任务里面，将文件批量化移动到某些文件夹去似乎是一项必须有现成脚本的事，这样可以省去很多麻烦，一键搞定。

先给大家看一下目录结构跟要完成的任务，首先我们有一堆文件夹，这个文件夹有很多层子目录，最终对应到某个物种的中文名跟拉丁文，也就是这样子的

然后，我们有一堆照片，已经整理好的，并且注上了中文的种名，也就是这样的

我们的目标就是将所有的照片移到对应的种的文件夹里面。

明白了之后，我们就可以开始写代码了

#首先，我们这次的环境中有中文，所以第一步，先引入中文识别
#coding=utf-8
#接着，我们要先得到目录的整个结构，这个时候我们需要引入os的包，来获取路径信息
import os

raw_dic = []
def get_file_path(file_dir):
    for root, dirs, files in os.walk(file_dir):
        raw_dic.append(root)
    return raw_dic
get_file_path("#此处输入文件夹的绝对路径")
print（raw_dic）

可以看到，此时返回的不仅仅是最后对应种的路径，还包括它的更上级路径，这个时候就需要经过一定筛选了，由于我这次是科属种这样分类下来的，那么我可以用“属”作为关键字对无关的内容进行过滤，如果你们遇到其他情况，也请根据具体情况，选择过滤的内容

final_dic = []
for i in raw_dic:
    if "属" in i.split("")[-2]:
        final_dic.append(i)
for i in final_dic:#检查一下输出来的是什么东西
    print(i)

嗯，对了，那这样我们就得到了最终我们要的那个目录了，接着我们来获取一下文件的路径，有了上面的那个内容，相信一下子就能写出来

file_name = []
def file_path(file_dir):
    for root, dirs, files in os.walk(file_dir):
        for i in files:
            strings = str(root) + "" + str(i)
            file_name.append(strings)
    return file_name
file_name("#输入物种照片存放的路径")

OK，那么这样我们就已经获得了两个内容了，接着我们就需要将照片放入指定的文件夹

import shutil ###如果不明白这个包是干嘛的，还请自行百度
import re
for line_one in final_dic:
    species_name = line_one.split("")[-1]
    for line_two in file_name:
        species_picture = line_two.split("")[-1]
        cop = re.compile("[u4e00-u9fa5]")###此处就是将照片名字里面非中文的内容全部去掉，只保留中文
        species = cop.sub("",species_picture)
        if species in species_name:
            shutil.copy(line_two,line_one)###如果不想保留原位置照片，可以用move

这样我们的整个雏形就完成了，那么接下来让我们开始让它可以在命令行里面快速输入，而不用每次都打开jupyter来修改路径内容

#coding=utf-8
import sys ###使用这个包的argv传入命令行的参数，这样我们就可以直接在命令行内输入两个路径来得到最终的结果了
import os
import shutil
import re
file_dic = []
raw_dic = []
def get_file_dic(file_dir):
    for root,dirs, files in os.walk(file_dir):
        raw_dic.append(root)
    return raw_dic
get_file_dic(sys.argv[1])
for i in raw_dic:
    if "属" in i.split("")[-2]:
         file_dic.append(i)
picture_path = []
def get_picture_path(file_dir):
    for root, dirs, files in os.walk(file_dir):
        for i in files:
            strings = str(root) + "" + str(i)
            picture_path.append(strings)
    return picture_path
get_picture_path(sys.argv[2])
for file_path in file_dic:
    species_name = file_path.split("")[-1]
    for species_path in picture_path:
        species_picture = species_path.split("")[-1]
        only_chinese = re.compile("[u4e00-u9fa5]")
        species = only_chinese.sub("", species_picture)
        if species in species_name:
            shutil.copy(species_path, file_path)

什么？ ，你觉得这样不够友好，需要再优雅一些，最好是提示输入两个参数再执行，ok，那我们再改一下

#coding=utf-8
import os
import shutil
import re
print("请输入文件夹目录的路径")
x = input()
print("请输入文件所在路径")
y = input()
file_dic = []
raw_dic = []
def get_file_dic(file_dir):
    for root,dirs, files in os.walk(file_dir):
        raw_dic.append(root)
    return raw_dic
get_file_dic(x)
for i in raw_dic:
    if "属" in i.split("")[-2]:
         file_dic.append(i)
picture_path = []
def get_picture_path(file_dir):
    for root, dirs, files in os.walk(file_dir):
        for i in files:
            strings = str(root) + "" + str(i)
            picture_path.append(strings)
    return picture_path
get_picture_path(y)
for file_path in file_dic:
    species_name = file_path.split("")[-1]
    for species_path in picture_path:
        species_picture = species_path.split("")[-1]
        only_chinese = re.compile("[u4e00-u9fa5]")
        species = only_chinese.sub("", species_picture)
        if species in species_name:
            shutil.copy(species_path, file_path)
print("任务已完成，请检查是否成功")

OK，这样我们就完成了整个脚本的书写与测试，如果有什么疑问欢迎在下方留言或者发送到825526231@qq.com，懂的问题我一定会倾力答复，我们下次再见！

练习链接：链接: https://pan.baidu.com/s/1kSyJVFrjqVSrG4qcrBrAtg 提取码: 7y5k 复制这段内容后打开百度网盘手机App，操作更方便哦