［笔试题］DNA序列

题目来源：

https://www.nowcoder.com/questionTerminal/e8480ed7501640709354db1cc4ffd42a?toCommentId=140458

题目描述：

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例（定义为GC-Ratio）是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列，以及要求的最小子序列长度，研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

测试用例：

输入一个string型基因序列，和int型子串的长度

找出GC比例最高的子串,如果有多个输出第一个的子串

输入
AACTGTGCACGACCTGA
5
输出
GCACG

思想：

本题相当于遍历字符串，以每个下标为开始，进行提取子串。
然后相当于找最大值一样，依次打擂台。找到最大值的GC比例。

这里有一个逻辑上的难点，那就是给定了dna序列，和子串长度，需要遍历几次？

我们来举个栗子分析一哈～～

最后一个子串的下标为：dna序列的长度－子串个数 

代码：

import java.util.*;
public class Main {
  //返回一个字符串的GC比例
  public static double GiveRatio(String str) {
        int count=0;
        double ratio=0;//这里要用double型，如果用int型，2/5的结果为0
        /*
        for(char ch : str.toCharArray()){
        if(ch=='G' || ch=='C') {
        count++;
            }
        }*/
        char[] c=str.toCharArray();
        if(c[count]=='C'||c[count]=='G') {
            for (; count < str.length(); count++) {
            }
        }
        radio=count/(double)str.length();
        return radio;
    }
    public static void main(String[] args) {
        Scanner scanner=new Scanner(System.in);
        String dna=scanner.nextLine();//String型基因序列
        int usedSized=scanner.nextInt();//int型子串长度
        String maxstr=" ";//记录比例最高的字符串
        double maxradio=0.0;//记录最高比例
        //最后一个子串的下标：i=dna.length()-usedSized
        for(int i=0;i<=dna.length()-usedSized;i++){
            //用substring()每次截取长度为usedSized的子串
            String str=dna.substring(i,i+usedSized);//截取子串的起始点i,结束点为i+usedSized
            if(giveRatio(str)>maxradio){
                maxstr=str;
                maxradio=giveRatio(maxstr);
            }
        }
        System.out.println(maxstr);
    }
}