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原创 在 AutoDL 平台配置 U-Mamba 环境并训练医学图像分割

最近,处理长序列任务的 Mamba 模型较为火爆。U-Mamba 的作者设计了一个混合的 CNN-SSM(卷积神经网络 - 状态空间序列模型)块,它结合了 CNN 的局部特征提取能力以及 SSM 捕捉长距离依赖的能力,还充分利用了 UNet 的 U 型结构的优势,从而提出了 U-Mamba 网络。通过在 AutoDL 平台配置 U-Mamba 环境并训练医学图像分割

2024-07-06 22:29:13 938 13

原创 用lifelines进行生存分析【Python版】

开篇语生存分析在医学研究中占有很大的比例,而且进行生存分析时,多用R语言、SPSS等工具进行生存分析,用python进行生存分析不多。因为发现一个python版的生存分析工具—lifelines ,这个库已经提供比较完善的生存分析相关的工具。自己又最近学习生存分析,然后结合lifelines开始编写这个项目。写代码的同时,也对一些生存分析中概念性的名词,根据自己的理解一起展示出来。因为是边学边写,有错误的地方请指正 。#安装生存分析用的python库----lifelines#lifelines相关

2022-02-24 19:56:23 8288 12

原创 实现影像组学全流程

需要完整代码到这里https://aistudio.baidu.com/aistudio/projectdetail/3270880 fork项目之后下载glioma.7z压缩包,然后用RStudio的RMarkdown进行运行1.项目介绍2012年荷兰学者提出影像组学(radiomics)概念:借助计算机,从医学影像中挖掘海量定量影像特征,使用统计学/机器学习方法,筛选出最有价值的影像学特征,用来解析临床信息。可以说影像组学是人工智能在医学领域的一种特定研究方式。做影像组学一般会经过以下步骤1

2021-12-23 11:15:17 13225 11

原创 入门篇:医学影像组学与机器学习(进入飞桨Aistudio平台,不用配置环境,开箱即用)

背景影像组学的概念最早由荷兰学者在2012年提出,其强调的深层次含义是指从影像(CT、MRI、PET等)中高通量地提取大量影像信息,实现肿瘤分割、特征提取与模型建立,凭借对海量影像数据信息进行更深层次的挖掘、预测和分析来辅助医师做出最准确的诊断。影像组学大致流程是:影像数据的收集->兴趣区ROI的勾画->兴趣区域的分割->提取特征、量化特征->建立模型->分类/预测。发现特征处理、建立模型、分类/预测这些步骤方法涉及机器学习。所以一边学习一边做记录,过一下影像组学的流程

2021-04-03 09:44:45 7108 9

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