DDSM乳腺钼靶图像数据库——ftp下载与格式转换（LJPEG转PNG）

本文详细介绍了如何使用Winscp软件下载DDSM数据库中的乳腺癌图像数据集，包括cancer、normal、benign和benign_without_callback四类数据。此外，还提供了一种将LJPEG格式图像转换为PNG格式的方法，通过使用DDSM-LJPEG-Converter程序，可以批量处理LJPEG文件，实现格式转换。

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参考：https://blog.csdn.net/yixieling4397/article/details/81321870
完成：ROC win10
DDSM数据库是美国的医学机构所建立的专门存放乳腺癌图像的数据库。里面存放了cancer，normal，benign，benign_without_callback四类数据。目前很多对乳腺癌的研究都是根据该数据库进行研究。接下来本文将会针对DDSM数据库的下载，格式转化方面展开介绍。

1.下载数据

我们的下载工具是winscp软件，该软件可以用于远程ftp下载。
在这里插入图片描述
首先，在网上搜索安装包进行下载安装。

在这里插入图片描述
安装之后，打开软件。

选择ftp，输入DDSM网址，匿名登录。

等待连接以后，就可以看到我们需要下载的资源，然后选择我们需要下载的资源，点击下载即可。（亲测，晚上的网速特别快，白天的网速特别慢，大家可以晚上让它自己去下载，我们去睡觉）
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原文链接：https://blog.csdn.net/yixieling4397/article/details/81321870

格式转换

参考：https://blog.csdn.net/liuxinghan1998/article/details/91493334
完成：台式 win10

一、简介

本文的程序是在曼彻斯特大学的 Dr. Chris Rose 编写的程序基础上修改而成。原程序的官网已经关闭，但在Github上还有镜像存储库。

原程序主要有两个功能：

从FTP服务器下载图像
将LJPEG格式转化为png格式
但实际上，程序在从FTP服务器下载时，一旦传输中断，程序就会终止。而且程序运行需要手动依次输入图像名称，一次只能处理一张图像，一张图像处理完后才能处理下一张，很费时费力。

所以建议使用专业的FTP下载软件下载DDSM的数据集，这样在与FTP服务器的连接发生中断时，软件会自动尝试重新连接。

本文的程序去除了原程序下载的功能，只保留了格式转换的功能，并添加了批处理功能。程序首先会深层遍历程序所在文件夹，将所有.LJPEG后缀文件的路径写入一个临时文本中。之后逐行读取这个文本，根据每次读取的路径加载相应的LJPEG文件，并同时读取该路径下相应的.ics文件中的信息，经过几步转换，最终将该LJPEG文件转换为PNG格式。如此，将所有LJPEG文件逐个转换为PNG格式。

程序的下载见：https://github.com/Watanuki-Kimihiro/DDSM-LJPEG-Converter

二、程序运行环境

Windows 系统
Cygwin (Unix虚拟机)
三、在Windows系统下安装Cygwin
Cygwin的安装比较简单，在Cygwin官网(http://www.cygwin.com/)下载好在线安装程序，在安装过程中除了有以下几点需要注意的地方外，剩下的一路点“下一步”就可以了。

在选择“Install for”时，要选择“Just Me”。
在选择安装的模块时，需要勾选“ImageMagick”，“ruby” ，“ rubygems”。

“ImageMagick”，“ruby” 和“ rubygems”这三个模块是本文程序所依赖的三个模块，为了能够运行本文中的程序必须安装。

使用安装程序窗口中的搜索框，就可以很方便地搜索到这三个模块。

四、程序使用

Cygwin安装好后，双击桌面上的“Cygwin64 Terminal”快捷方式打开终端，初次运行会在安装目录下生成用户目录，比如Cygwin的默认安装路径是C:\cygwin64，初次运行后就会生成用户目录：C:\cygwin64\home\YourUserName，其中“YourUserName”是你的Windows系统的用户名。

把下载好的 DDSM-LJPEG-Converter 文件夹拷贝到Cygwin用户目录(C:\cygwin64\home\YourUserName)下
拷贝LJPEG图片文件夹到 DDSM-LJPEG-Converter 文件夹下

这个LJPEG图片文件夹可以是一个嵌套的文件夹，但必须保证：

LJPEG文件与ics文件的文件名保持FTP服务器提供的文件名，即不要修改从FTP服务器下载下来的文件名称，因为本程序是根据文件名来关联LJPEG文件与相应的ics文件的。
待转换的LJPEG文件，以及与该文件相关联的ics文件，必须在同一路径下。因为本程序只对LJPEG文件进行了深层遍历，而对于ics文件，只是在待转换的LJPEG文件所在的路径进行了遍历。如果是用FTP下载软件下载的，就不用移动文件，因为DDSM的FTP服务器文件结构就是如此。
总之，如果是用FTP下载软件下载的，不要进行任何改动，直接将整个文件夹拷贝到 DDSM-LJPEG-Converter 文件夹下就可以了。

运行脚本

打开终端后，首先切换文件目录到 DDSM-LJPEG-Converter 文件夹下。

cd DDSM-LJPEG-Converter
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然后运行脚本。

./LJPEG-to-png
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运行结果：

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