Windows平台IGV[Integrative Genomics Viewer] 初次使用过程(吐槽)

IGV 的功能

简言之，适用于reads覆盖度的成图。

以下复制于：https://www.cnblogs.com/leezx/p/5603481.html
整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具，用来交互式地探索大型综合基因组数据。它支持各种数据类型，包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释。IGV这个工具很牛，发了NB：
James T. Robinson, Helga Thorvaldsdóttir, Wendy Winckler, Mitchell Guttman, Eric S. Lander, Gad Getz, Jill P. Mesirov. Integrative Genomics Viewer. Nature Biotechnology 29, 24–26 (2011)。

1.下载安装

windows平台下直接登陆 官方网站 下载安装即可，最好纯英文目录安装

2.使用

安装过程中可选择在桌面生成快捷方式，或者直接进入安装目录运行 igv.bat

• 注意：IGV只是一个比对结果的展示工具，本身不具备比对功能，所以需要输入的文件有：
  1、基因组参考序列（*.fasta）
  2、比对软件生成的bam文件

2.1 加载参考基因组数据