生信学习
Lifelrving
脆弱的人才会四处游说自己的不幸,坚强的人只会不动声色地愈渐坚强
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linux裸机安装经验
由于我拿到的是已经下载好了Centos 7的U盘,所以直接用该U盘在裸机上安装设备:DellR740如果没有将设备改为U盘可启动项,需要在bios中设置,开机时,在左上角看到System Setup(F2),进入,找到boot squence相关选项,选择UEF1,并且Genetic USB Boot 设置为enable即可,保存。(这一步在R740中已经省去,因为U盘启动已经开启)重新开机:在左上角看到Boot Manager(F11)进入:选择One-shot:多种启动方式,选择Genetic原创 2020-06-29 22:44:59 · 1551 阅读 · 0 评论 -
生信学习——转录组测序分析的大致流程
如果想要从最原始的测序结果开始分析,如何分析?转录组测序的分析流程大致可以分成三类,包括基因组比对( Genome mapping )、转录组比对(Transcriptome mapping)、转录组组装(Reference-free assembly)有大牛写的很好:聊聊转录组测序——2.数据分析与解读(上)原始数据一般下载得到的是Fastq文件格式:每一条序列(read)包含四行,第一行是read的ID,第二行是序列,第四行是序列中每个碱基的测序质量但是由于有的reads测序质量较低,可能需要去原创 2020-06-28 16:32:11 · 6661 阅读 · 0 评论 -
生信学习——TGCA数据库的命名原则
在TGCA数据库中一个患者至多对应两个样本,但在原始选区的时候,一共是有多个样本可以选取的,从这多个样本中选取阴性(癌旁组织)和阳性(癌组织)最好的那个,当然,如果只有阳性或阴性的话,那么至多只有1个样本。如:TGCA-A6-6650-01A-11R-1174-07TGCA-A6-6650-01A-11R-A278-07TGCA-A6-6650-01B-02R-A277-07一般我们只能看到前4组数字,即TGCA-A6-6650-01A,也就是另外2个样本被舍弃了,舍弃原则:TGCA-Projec原创 2020-06-28 10:26:35 · 1008 阅读 · 0 评论