医学分割学习记录-AMOS22数据预处理(nnUnet)
cropping.py:通过label产生mask,再通过mask对ct和label进行crop.本数据集很多数据cropping没有效果,有效果的也不会抛去很多size,也许是我的代码有问题.之后该写Dataloader和Net了,先在Unet上试一试.之前跑通的3DUnet是整个数据集训练的,AMOS数据集处理前后的Size都是不统一的,需要写基于Patch的网络训练.写的代码比较稚嫩,而且为了便于debug,一步一步是分开写的,每一步都保存了数据,通过3Dslicer可以很直观的看出来有没有问题.
原创
2022-10-12 20:11:46 ·
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