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原创 AI 解读 spateo 源码
Spateo是一个由华大基因(BGI)研究团队开发的开源空间转录组分析软件包,为空间组学研究提供了一套全面而系统的解决方案。细胞分割基于DAPI/Hoechst核酸染色的细胞核分割基于RNA信号分布的无染色细胞分割集成了分水岭算法等先进的图像处理技术空间结构分析基于K近邻(KNN)图的空间约束聚类(SCC)算法用于识别和表征连续的组织结构域支持多尺度的空间结构分析差异分析整合空间信息的差异表达分析考虑细胞空间位置的统计检验方法空间相关性分析细胞通讯分析。
2024-11-27 14:37:39
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空空如也
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