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原创 MEDSAMreadme
我们提供了一个小数据集的分步教程,帮助您快速开始培训过程。数据准备和预处理下载SAM检查点并将其放置在work_dir/SAM/SAM_vit_b_01ec64.pth。下载演示数据集并解压缩。该数据集包含50次腹部CT扫描,每次扫描都包含一个带有13个器官的注释掩码。器官标签的名称可在MICCAI FLARE2022上找到。在本教程中,我们将对胆囊分割的SAM进行微调。运行预处理分割数据集:80%用于训练,20%用于测试图像归一化预计算图像嵌入。
2023-05-16 20:54:51 997 1
原创 Segment Anything in Medical Images翻译
分隔任何模型(SAM)已经彻底改变了自然图像分割,但其在医学图像上的性能是有限的。这项工作提出了MedSAM,这是第一次尝试将SAM的成功扩展到医学图像,其目标是创建一个通用的工具,用于分割各种医疗目标。具体来说,我们首先策划了一个大规模的医学图像数据集,包括跨越11种不同模式的超过20万种掩码。然后,我们开发了一种简单的微调方法,使SAM适应于一般的医学图像分割。
2023-05-16 19:47:55 964
原创 在conda虚拟环境下快捷启动jupyter notebook
1复制一份虚拟环境下的jupyter的快捷方式到桌面,rename一个方便区分的名字,比如我是以虚拟环境命名的。2右击刚才复制并重命名的快捷方式--->点击属性,如下图,只需要修改目标和起始位置(具体作用我不清楚,个人理解目标是配置环境的,起始位置是设置默认打开的文件夹的,个人癖好喜欢把文件放在一个文件夹里,所以在f盘新建了一个名字为jupyter_file文件夹,以后所有先新建的jupyterwe文件都保存在这个文件夹下,方便管理)目标里面的值为:E:\Anaconda\p.
2022-04-19 21:42:23 1660
原创 pycharm快速格式化代码
1.Anaconda already installed+pip安装包2.pip install balck3.where black4.打开pycharm,点击File ->settings->tools->External tools->+5.$FilePath$ $ProjectFileDir$如图输入,点击OK6.使用的时候如图操作即可...
2022-03-30 20:24:42 1457
原创 jupyter查看python包
1,在jupyter|中运行下面语句可以查看当前环境下可以使用的python包!pip list2.可以查看当前python解释器import sysprint(sys.version)print(sys.executable)
2022-03-19 21:59:29 6368
原创 anacoanda创建虚拟环境
1.创建虚拟环境:打开anaconda prompt注意!envname根据自己的情况设置,是虚拟环境的名字。可以指定python版本,也可以不用conda create -n envname python=3.7或conda create -n envname2.激活环境:conda activate envname进入对应的虚拟环境后可以查看python版本3.退出环境:conda deactivate...
2022-03-18 16:28:04 560
原创 jupyter出现内核启动失败问题
win10+miniconda1.报错问题:KernelRestarter: restart failed2.解决方案:pip3 install --upgrade ipykernel
2022-03-16 15:50:29 1380
原创 win10彻底删除jupyter
1进入安装jupyter的环境下2依次执行:pip uninstall jupyter -ypip uninstall jupyter_core -ypip uninstall jupyter-client -ypip uninstall jupyter-console -ypip uninstall notebook -ypip uninstall qtconsole -ypip uninstall nbconvert -ypip uninstall nbformat -y...
2022-03-16 15:47:31 1339
空空如也
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