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RSS订阅原创 R语言安装包出现前置安装包版本不够
R语言在安装包是通常都是install.packages()一键安装，但有时会由于部分包长时间没有更新导致安装新的包的时候出现前置包版本过低的问题。如果前置包之前没有安装，它会提醒你是否安装，这时一键安装就好了。但有的时候我们这个包之前就已经安装过了，所以没法自动安装，报错。载入了名字空间‘Matrix’ 1.5-1，但需要的是>= 1.6.0。1: 程辑包‘ggpmisc’是用R版本4.2.3 来建造的。2: 程辑包‘ggpp’是用R版本4.2.3 来建造的。并再次安装对应需要的包。
2024-04-17 23:08:45
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原创 R语言group_by出现bug显示分组但是计算结果并没有分组
Error: ‘ggbiplot’需要程辑包‘plyr’，因此不能将之分离。显示分组正确，但是使用summarise进行计算时无法分组计算。在进行批量统计时经常使用group_by函数通过通道进行计算。查询问题为该函数与基础包里的plyr包冲突了需要解除关联。于是单独对ggbiplot进行去激活。但运行中出现单独使用。
2024-02-27 17:51:14
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原创 转录组Unigene 筛选ORF，翻译成蛋白质
conda安装TransDecoder，也可在github上直接获取。通过blast或者pfam搜索已知蛋白的同源序列来识别ORF。使用软件TransDecoder。使用 TransDecoder。
2024-01-27 21:20:11
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原创 qiime2运行发生Plugin error from feature-classifier: [Errno 28] No space left on device
解决办法为在代码中加入--p-n-jobs n限制线程数，但是我本身线程和内存够用不是这个问题。将文件夹写进路径 export TMPDIR=/home/niuqc/tempo/查找网上说法共有两类，一类是认为qiime2运行时parallel过高导致，于是新建文件夹mkdir home/niuqc/tempo。echo $TMPDIR，发现确实没有返回值。另一个说法是缺少TMPDIR文件目录导致。再次运行源代码，问题解决。
2023-12-12 23:40:40
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空空如也
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