weixin_46354421的博客

原创 python调用fsl预处理fMRI

经过排查，发现是用os.system执行系统命令，如果该指令需要的时间较长，那么没等system执行完毕，python就会执行下一条代码，因为后面的代码需要用到前面的输出结果，所以就会报错。之前写了python脚本调用fsl的指令来进行对功能像和DTI的预处理，用的函数是os.system(cmd),结果脚本运行起来总会报路径错误，如下图所示。解决方法：改用subprocess来执行系统命令。