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原创 肠道菌群现有问题和体外研究的希望
1,由于“正常”或“健康”微生物组还未被准确定义,术语“紊乱”仅指与特定疾病或状况相关的微生物组与对照相比的变化。3,横断面研究不能确定观察到关联研究中的因果关系,纳入标准和检测指标的差异使得很难对研究结果进行比较分析。(因此还需要后期干预和验证加以分析因果关系)4,尽管全基因组测序的使用使我们能够探索预测代谢谱,但需要使用粪便代谢组学和体外研究来证实微生物功能和代谢物的增加或减少。2,研究表明,长期的习惯性饮食对肠道“核心”微生物群的组成和功能有更大的影响,而短期干预只会产生暂时的影响。
2023-03-30 14:25:39
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原创 AlphaFold2预测蛋白、肽结构网站简易版教程
最近AlphaFold因为预测蛋白质结构准确率之高,并在7月于nature上发表论文,公开AlphaFold2源代码之后着实火了一把。这种能站在巨人肩膀上干活的人都在跃跃欲试。瞧,领导任务来了,菜鸟小象,看看这个能否预测我们的多肽结构,于是就开始了研究AlphaFold的使用方法,虽然限制重重,但还是不辱使命,简易版AlphaFold2使用方法来了,记录一下过程。b站作为年轻人最常使用的软件,流量会让资源越来越丰富,对于懒癌患者的小象,着手研究AlphaFold使用方法的第一反应是去b站找教程。b站也.
2021-08-12 10:58:11
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原创 picrust2功能预测-从qiime2安装到数据分析
记录一下跌跌撞撞地摸索过程picrust2功能预测参照公众号《宏基因组》刘永鑫的原创:《PICRUSt2:OTU或ASV等16S随便预测宏基因组且数据库增加10倍》https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/89302863注:命令中 \为断行用,实际上输入命令要去掉,在输入文件路径时没有用此符号断行。虚拟机与qiime2安装参照公众...
2020-04-17 17:21:51
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空空如也
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